Latinsko ime  |
Slovensko ime |
Dodatno slovensko ime |
 |
| Abies alba | jelka | | 8 |
| Abramis brama | ploščič | | 1 |
| Abraxas grossulariata | | | 1 |
| Abutilon theophrasti | baržunasti oslez | | 1 |
| Acer campestre | maklen | | 6 |
| Acer monspessulanum | trokrpi javor | | 1 |
| Acer negundo | amerikanski javor | | 7 |
| Acer obtusatum | topokrpi javor | | 2 |
| Acer platanoides | ostrolistni javor | | 2 |
| Acer pseudoplatanus | beli javor | | 5 |
| Acer sp. | javor | | 1 |
| Acer tataricum | tatarski javor | | 1 |
| Acherontia atropos | smrtoglavec | | 1 |
| Achillea clavenae | planinski pelin | | 1 |
| Achillea ptarmica | pehtranov rman | | 6 |
| Achillea sp. | rman | | 2 |
| Acinos alpinus | alpski šetrajnik | | 3 |
| Acinos sp. | šetrajnik | | 2 |
| Aconitum angustifolium | ozkolistna preobjeda | | 1 |
| Aconitum lycoctonum ssp. ranunculifolium | | | 2 |
| Aconitum sp. | preobjeda | | 1 |
| Aconitum variegatum | pisana preobjeda | | 2 |
| Acorus calamus | pravi kolmež | | 3 |
| Acronicta psi | | | 2 |
| Acronicta rumicis | | | 2 |
| Acronicta tridens | | | 1 |
| Actaea spicata | navadna črnoga | | 1 |
| Actinotia polyodon | | | 1 |
| Aculepeira ceropegia | | | 1 |
| Adenostyles alliariae | dlakavi lepen | | 2 |
| Adenostyles glabra | goli lepen | | 2 |
| Adiantum capillus-veneris | venerini laski | | 2 |
| Adoxa moschatellina | navadna pižmica | | 4 |
| Adscita mannii | | | 2 |
| Aedes albopictus | tigrasti komar | | 1 |
| Aegithalos caudatus | dolgorepka | sinica dolgorepka, navadna dolgorepka, dolgorepka, beloglavka, mlinarček, gaugarica | 2 |
| Aegolius funereus | koconogi čuk | koconoga sova, koconogi skovik, kosmatonoga sova, kocasti skovik | 2 |
| Aegomorphus clavipes | | | 1 |
| Aegopodium podagraria | navadna regačica | | 4 |
| Aesculus hippocastanum | navadni divji kostanj | | 6 |
| Aeshna cyanea | zelenomodra deva | | 26 |
| Aeshna isoceles | deviški pastir | | 2 |
| Aeshna juncea | barjanska deva | | 2 |
| Aeshna mixta | bleda deva | | 2 |
| Aeshna sp. | deva | | 1 |
| Aeshna viridis | zelena deva | | 4 |
| Aethalura punctulata | | | 1 |
| Agapanthia villosoviridescens | | | 1 |
| Aglais io | dnevni pavlinček | | 4 |
| Aglais urticae | mali koprivar | | 9 |
| Aglia tau | beli T | | 9 |
| Agonopterix arenella | | | 1 |
| Agrimonia eupatoria | navadni repik | | 2 |
| Agriopis marginaria | | | 1 |
| Agrius convolvuli | slakov veščec, somračnik | | 4 |
| Agrochola circellaris | | | 1 |
| Agrochola macilenta | | | 1 |
| Agrochola nitida | | | 1 |
| Agrostemma githago | navadni kokalj | | 10 |
| Agrostis canina | pasja šopulja | | 2 |
| Agrostis sp. | šopulja | | 3 |
| Agrotis exclamationis | njivska sovka | | 2 |
| Agrotis ipsilon | | | 1 |
| Agrotis vestigialis | | | 1 |
| Ailanthus altissima | veliki pajesen | visoki pajesen, visoki ajlant, božje drevo | 6 |
| Ajuga reptans | plazeči skrečnik | | 3 |
| Ajuga sp. | skrečnik | | 1 |
| Albulina orbitulus | gorska bledica, gorski modrin | gorski modrin | 3 |
| Alburnoides bipunctatus | pisanka | | 9 |
| Alburnus alborella | primorska belica | | 13 |
| Alburnus alburnus | zelenika | | 7 |
| Alburnus mento | pegunica | | 1 |
| Alcedo atthis | vodomec | višnjevi vodomec, višnjevi kos, povodni kos, ribič | 4 |
| Alcis repandata | | | 1 |
| Algyroides nigropunctatus | črnopikčasta kuščarica | | 2 |
| Alisma lanceolatum | suličastolistni porečnik | | 3 |
| Alisma plantago | | | 1 |
| Alisma plantago-aquatica | trpotčasti porečnik | | 7 |
| Alisma plantago-aquatica agg. | skupina trpotčastega porečnika | | 3 |
| Alisma sp. | porečnik | | 3 |
| Alliaria petiolata | česnovka | | 4 |
| Allium angulosum | robati luk | | 1 |
| Allium carinatum ssp. carinatum | gredljati luk | | 1 |
| Allium ericetorum | rumenkasti luk | | 2 |
| Allium schoenoprasum ssp. alpinum | | | 2 |
| Allium scorodoprasum ssp. rotundum | | | 2 |
| Allium scorodoprasum ssp. scorodoprasum | divji luk | | 2 |
| Allium sp. | luk | | 5 |
| Allium ursinum | čemaž | | 25 |
| Allium victorialis | vanež | | 2 |
| Allium vineale | vinograjski luk | | 1 |
| Allophyes oxyacanthae | | | 4 |
| Alnus glutinosa | črna jelša | | 43 |
| Alnus incana | siva jelša | | 5 |
| Alnus viridis | zelena jelša | | 1 |
| Alopecurus aequalis | kratkoresi lisičji rep | | 2 |
| Alopecurus pratensis | travniški lisičji rep | | 7 |
| Alopochen aegyptiacus | nilska gos | egipčanska gos | 5 |
| Alsophila aescularia | | | 1 |
| Althaea officinalis | navadni slez | | 1 |
| Amanita sp. | | | 4 |
| Amaranthus retroflexus | navadni ščir | | 1 |
| Amata phegea | | | 8 |
| Amaurobiidae | Kodrači (Temačniki) | | 2 |
| Amaurobius sp. | | | 1 |
| Ambrosia artemisiifolia | pelinolistna žvrklja | | 6 |
| Ameiurus melas | črni somič | pegasti somič, črni ameriški somič | 9 |
| Ameiurus sp. | somiči | ameriški somiči | 3 |
| Amelanchier ovalis | šmarna hrušica | | 4 |
| Ammoconia caecimacula | | | 1 |
| Amorpha fruticosa | amorfa | | 10 |
| Amphibia | Dvoživke | | 1 |
| Anacamptis pyramidalis | piramidasti pilovec | | 17 |
| Anaciaeschna isoceles | deviški pastir | | 4 |
| Anagallis arvensis | navadna kurja češnjica | | 1 |
| Anarta cordigera | | | 1 |
| Anas platyrhynchos | mlakarica | divja raca, velika divja raca, navadna raca, velika raca | 11 |
| Anas querquedula | reglja | regeljc, krepljica raca | 3 |
| Anas sp. | race | | 1 |
| Anatidae | Plovci | | 1 |
| Anax ephippiger | afriški minljivec | | 2 |
| Anax imperator | veliki spremljevalec | | 27 |
| Anax sp. | spremljevalec | | 2 |
| Anchusa officinalis | navadni volovski jezik | | 1 |
| Androsace villosa | kuštravi oklep | | 4 |
| Anemone hortensis | vrtna vetrnica | | 1 |
| Anemone nemorosa | podlesna vetrnica | | 9 |
| Anemone ranunculoides | zlatična vetrnica | rumena vetrnica | 12 |
| Anemone trifolia | trilistna vetrnica | | 2 |
| Angelica sylvestris | navadni gozdni koren | | 3 |
| Angerona prunaria | | | 3 |
| Anguis fragilis | slepec, slepič, modropikčasti slepič | | 34 |
| Anisantha sterilis | jalovi glistnik | | 1 |
| Anodonta cygnea | velika brezzobka | | 10 |
| Anodonta sp. | brezzobke | | 3 |
| Anoplotrupes stercorosus | | | 1 |
| Anser anser | siva gos | divja gos, rumenokljunasta gos | 3 |
| Antennaria dioica | navadna majnica | | 1 |
| Antheraea yamamai | japonska sviloprejka | jamamaj | 8 |
| Anthericum ramosum | navadni kosmuljek | | 8 |
| Anthocharis cardamines | zorica | | 9 |
| Anthoxanthum odoratum | dišeča boljka | | 3 |
| Anthyllis jacquinii | Jacquinov ranjak | | 3 |
| Anthyllis sp. | ranjak | | 1 |
| Anthyllis vulneraria | pravi ranjak | | 6 |
| Anticlea derivata | | | 1 |
| Anura | Brezrepci ali žabe | | 3 |
| Apamea monoglypha | | | 2 |
| Apamea sublustris | | | 1 |
| Apatura ilia | mali spreminjavček | | 10 |
| Apatura iris | veliki spreminjavček | | 11 |
| Aphantopus hyperantus | okati rjavec | | 8 |
| Aphrophora salicina | | | 1 |
| Apiaceae | Kobulnice | | 7 |
| Apis mellifera | domača čebela (medonosna čebela) | | 8 |
| Aplocera plagiata | | | 1 |
| Aplocera praeformata | | | 1 |
| Apocheima pilosaria | | | 1 |
| Apoda limacodes | | | 1 |
| Apodemus agrarius | dimasta miš | | 2 |
| Apodemus flavicollis | rumenogrla miš | | 1 |
| Aporia crataegi | glogova belinka | glogovec | 9 |
| Aposeris foetida | navadna smrdljivka | | 2 |
| Apus apus | hudournik | črni hudournik, navadni hudournik, zidovni hudournik, veliki hudournik, velika lastovka | 6 |
| Aquilegia atrata | črnikastovijolična orlica | | 1 |
| Aquilegia einseleana | Einselejeva orlica | | 2 |
| Aquilegia nigricans | velecvetna orlica | | 8 |
| Aquilegia sp. | orlica | | 3 |
| Aquilegia vulgaris | navadna orlica | | 2 |
| Aquilegia vulgaris agg. | skupina navadne orlice | | 4 |
| Arabis alpina ssp. alpina | alpski repnjak, planinski repnjak | | 2 |
| Arabis turrita | slokastoplodni repnjak | | 1 |
| Arachnida | Pajkovci | | 2 |
| Aranea | Pajki | | 15 |
| Araneidae | Križevci (Mrežarji) | | 2 |
| Araneus diadematus | navadni križevec | | 1 |
| Araneus quadratus | | | 1 |
| Araneus sp. | | | 2 |
| Araschnia levana | koprivov pajčevinar | pegavček | 16 |
| Archiearis notha | | | 1 |
| Arctia villica | | | 1 |
| Arctium lappa | navadni repinec | | 2 |
| Arctium nemorosum | gozdni repinec | | 2 |
| Arctium sp. | repinec | | 4 |
| Arctium tomentosum | volnati repinec | | 9 |
| Arctostaphylos uva-ursi | vednozeleni gornik | | 2 |
| Ardea cinerea | siva čaplja | sivi rangar, ragar | 11 |
| Aremonia agrimonoides | navadni strček | | 1 |
| Arethusana arethusa | okrasti košeničar | | 13 |
| Argiope bruennichi | osasti pajek | | 5 |
| Argulus foliaceus | krapova uš | | 1 |
| Argynnis adippe | pisani bisernik | | 13 |
| Argynnis aglaja | bleščeči bisernik | | 10 |
| Argynnis niobe | temni bisernik | | 2 |
| Argynnis paphia | gospica | | 19 |
| Aricia agestis | navadna rjavka | | 4 |
| Aricia artaxerxes | hribska rjavka | | 9 |
| Aricia eumedon | krvomočničina rjavka | | 3 |
| Arion sp. | lazarji | | 2 |
| Aristolochia clematitis | navadni podraščec | | 13 |
| Aristolochia lutea | rumeni podraščec | | 1 |
| Aristolochia pallida | bledi podraščec | | 1 |
| Aristolochia sp. | podraščec | | 11 |
| Armeria alpina | alpski pečnik | | 3 |
| Arnica montana | navadna arnika | | 11 |
| Aromia moschata | moškatni kozliček | | 2 |
| Artemia salina | solinski rakec, artemija | | 1 |
| Arum italicum | laški kačnik | | 1 |
| Arum maculatum | pegasti kačnik | | 7 |
| Arum maculatum agg. | skupina pegastega kačnika | | 3 |
| Arum sp. | kačnik | | 2 |
| Aruncus dioicus | navadno kresničevje | | 6 |
| Arundo donax | navadna kanela | | 4 |
| Asarum europaeum | navadni kopitnik | | 3 |
| Asclepias syriaca | sirska svilnica | | 5 |
| Asellus aquaticus | | | 1 |
| Asio otus | mala uharica | gozdna uharica, lesna uharica, mala sova, mala uhasta sova, mala uhata sova | 2 |
| Asparagus acutifolius | ostrolistni beluš | | 3 |
| Asparagus officinalis | navadni beluš | | 4 |
| Asparagus tenuifolius | lasasti beluš | | 5 |
| Asphodelus albus | navadni zlati koren | | 19 |
| Aspius aspius | bolen | | 6 |
| Asplenium ruta-muraria | pozidna rutica | | 4 |
| Asplenium seelosii | Seelosov sršaj | | 1 |
| Asplenium trichomanes | rjavi sršaj | | 3 |
| Asplenium viride | zeleni sršaj | | 1 |
| Astacidae | | | 2 |
| Astacus astacus | jelševec | potočni rak, plemeniti rak | 88 |
| Asteraceae | Nebinovke | | 1 |
| Aster alpinus | alpska nebina | | 5 |
| Aster amellus | gorska nebina | | 5 |
| Aster bellidiastrum | marjetičasta nebina | | 3 |
| Astragalus glycyphyllos | sladki grahovec | | 2 |
| Astrantia bavarica | bavarski zali kobulček | | 1 |
| Astrantia carniolica | kranjski zali kobulček | | 2 |
| Astrantia major | veliki zali kobulček | | 2 |
| Atolmis rubricollis | | | 1 |
| Atropa bella-donna | volčja češnja | | 5 |
| Atypus sp. | | | 2 |
| Austropotamobius pallipes | koščenec | primorski koščak, belonožec, belonogi rak | 93 |
| Austropotamobius torrentium | koščak | navadni koščak, rak koščak | 487 |
| Autographa gamma | glagolka | | 2 |
| Avena sativa | navadni oves | | 3 |
| Aves | Ptice | | 5 |
| Axylia putris | | | 1 |
| Barbastella barbastellus | širokouhi (mulasti) netopir | | 33 |
| Barbatula barbatula | babica | | 18 |
| Barbitistes serricauda | | | 1 |
| Barbitistes sp. | | | 1 |
| Barbus balcanicus | pohra | | 27 |
| Barbus barbus | mrena | | 18 |
| Barbus caninus | mrenič | | 6 |
| Barbus plebejus | grba | | 15 |
| Barbus sp. | mrene | | 2 |
| Bartsia alpina | alpska barčija | | 1 |
| Bellis perennis | navadna marjetica | | 1 |
| Bena bicolorana | | | 1 |
| Berberis thunbergii | Thunbergov češmin | | 2 |
| Berberis vulgaris | navadni češmin | | 13 |
| Berula erecta | ozkolistni koščec | | 1 |
| Betonica officinalis | navadni čistec | | 3 |
| Betula pendula | navadna breza | | 10 |
| Bibio sp. | | | 1 |
| Bidens tripartita | tridelni mrkač | | 1 |
| Biscutella laevigata | navadna šparnica | | 3 |
| Biston betularia | | | 1 |
| Biston strataria | | | 1 |
| Bivalvia | Školjke | | 14 |
| Blackstonia perfoliata | preraslolistna grenčica | | 3 |
| Blechnum spicant | rebrenjača | | 6 |
| Blicca bjoerkna | androga | | 4 |
| Bolboschoenus maritimus | obmorska srpica | | 3 |
| Bolboschoenus planiculmis | rjava srpica | | 3 |
| Boloria dia | mali tratar | | 7 |
| Boloria euphrosyne | pomladni tratar | | 3 |
| Boloria pales | gorski tratar | gorski višavar | 5 |
| Boloria selene | srebrni tratar | | 5 |
| Boloria thore | temni tratar | | 1 |
| Boloria titania | planinski tratar | vijolični tratar | 2 |
| Bombina bombina | nižinski urh | | 708 |
| Bombina bombina x variegata | | | 298 |
| Bombina sp. | urhi | | 4 |
| Bombina variegata | hribski urh | | 1404 |
| Bombina variegata variegata | | | 1 |
| Bombus sp. | čmrlji | | 8 |
| Botrychium virginianum | virginijska mladomesečina | | 1 |
| Brachionycha nubeculosa | | | 1 |
| Brachydesmus sp. | | | 1 |
| Brachypodium pinnatum | navadna glota | | 2 |
| Brachypodium pinnatum agg. | skupina navadne glote | | 3 |
| Brachypodium rupestre | skalna glota | | 8 |
| Brachypodium sp. | glota | | 1 |
| Brachytron pratense | zgodnji trstničar | | 6 |
| Brassicaceae | Križnice | | 5 |
| Brassica napus | navadna ogrščica | | 1 |
| Brassica rapa | repa | | 2 |
| Brenthis daphne | robidov livadar | | 6 |
| Brenthis hecate | dvopiki livadar | | 2 |
| Brenthis ino | močvirski livadar | | 5 |
| Brintesia circe | travnar | | 7 |
| Bromopsis erecta agg. | skupina pokončnega stoklasca | | 1 |
| Bromopsis sp. | stoklasec | | 1 |
| Bromus erectus | pokončna stoklasa | | 2 |
| Bromus erectus agg. | skupina pokončne stoklase | | 2 |
| Bromus hordeaceus ssp. pseudothominii | | | 4 |
| Bryophyta | Mahovi | | 22 |
| Buddleja davidii | Davidova budleja | | 1 |
| Bufo bufo | navadna krastača | | 394 |
| Bufo sp. | krastače | | 10 |
| Bufo viridis | zelena krastača | | 8 |
| Buglossoides purpurocaerulea | škrlatnomodro ptičje seme | | 1 |
| Buphthalmum salicifolium | vrbovolistni primožek | | 8 |
| Bupleurum petraeum | skalna prerast | | 1 |
| Buteo buteo | kanja | navadna kanja, mišar, mišja kanja, kanjek, kanjuh, srakolica | 2 |
| Butomus umbellatus | kobulasta vodoljuba | | 4 |
| Buxus sempervirens | navadni pušpan | | 1 |
| Cabera pusaria | | | 1 |
| Cacyreus marshalli | pelargonijev bakrenček | | 2 |
| Calamagrostis epigejos | navadna šašulica | | 5 |
| Calamagrostis sp. | šašulica | | 1 |
| Calla palustris | močvirska kačunka | | 8 |
| Callimorpha dominula | | | 4 |
| Callimorpha quadripunctaria | črtasti medvedek | ruski medvedek, črtalasti medvedek | 82 |
| Callistege mi | | | 3 |
| Calliteara pudibunda | | | 4 |
| Callitriche sp. | žabji las | | 20 |
| Callophrys rubi | zeleni robidar | robidovnik | 6 |
| Calluna vulgaris | jesenska vresa | | 7 |
| Calopteryx sp. | bleščavec | | 1 |
| Calopteryx splendens | pasasti bleščavec | | 15 |
| Calopteryx virgo | modri bleščavec | | 12 |
| Caltha palustris | navadna kalužnica | | 17 |
| Caltha palustris ssp. palustris | bleščeča kalužnica | | 1 |
| Calystegia sepium | navadni plotni slak | | 2 |
| Cameraria ohridella | kostanjev zavitkar, kostanjev listni zavrtač | | 2 |
| Campaea margaritata | | | 1 |
| Campanula barbata | brkata zvončica | | 1 |
| Campanula cespitosa | rušnata zvončica | | 1 |
| Campanula cochleariifolia | trebušasta zvončica | | 1 |
| Campanula glomerata | klobčasta zvončica | | 6 |
| Campanula patula | razprostrta zvončica | | 2 |
| Campanula persicifolia | breskovolistna zvončica | | 3 |
| Campanula pyramidalis | piramidasta zvončica | | 1 |
| Campanula rapunculus | repuščeva zvončica | | 4 |
| Campanula rotundifolia | okroglolistna zvončica | | 3 |
| Campanula sp. | zvončica | | 4 |
| Campanula thyrsoidea | | | 1 |
| Campanula thyrsoides | šopasta zvončica | | 4 |
| Campanula thyrsoides ssp. carniolica | | | 3 |
| Campanula trachelium | koprivasta zvončica | | 2 |
| Campanula zoysii | Zoisova zvončica | | 5 |
| Camptogramma bilineata | | | 1 |
| Canis lupus | volk | | 1 |
| Cannabis sativa | navadna konoplja | | 1 |
| Cannabis sativa ssp. sativa | | | 2 |
| Cantharelus cibarius | | | 1 |
| Cantharis sp. | | | 1 |
| Capra ibex | alpski kozorog | | 3 |
| Capreolus capreolus | srna | | 19 |
| Caprimulgus europaeus | podhujka | legen, kozodoj, ležetrudnik, mravljinčar, pikčasti mravljinčar ,kozomolzu, navadna podhujka | 1 |
| Capsella bursa-pastoris | navadni plešec | | 1 |
| Carabidae | Krešiči | | 4 |
| Carabus caelatus | hrapavi krešič | | 2 |
| Carabus cancellatus | bakreni krešič | | 1 |
| Carabus catenulatus | verigasti krešič | | 2 |
| Carabus coriaceus | usnjati krešič | | 8 |
| Carabus croaticus | | | 1 |
| Carabus gigas | | | 2 |
| Carabus granulatus | | | 1 |
| Carabus intricatus | modri krešič | | 1 |
| Carabus variolosus | močvirski krešič | | 5 |
| Carabus violaceus | močvirski krešič | | 2 |
| Caradrina morpheus | | | 1 |
| Carassius auratus | zlata ribica | zlati koreselj | 18 |
| Carassius carassius | navadni koreselj | navadni koreselj | 15 |
| Carassius gibelio | babuška | srebrni koreselj | 8 |
| Carcharodus alceae | slezenovčev kosmičar | | 3 |
| Carcharodus floccifera | močvirski kosmičar | močvirski ostrozob | 8 |
| Cardamine amara | grenka penuša | | 2 |
| Cardamine bulbifera | brstična konopnica | | 7 |
| Cardamine enneaphyllos | deveterolistna konopnica | | 4 |
| Cardamine kitaibelii | mnogolistna konopnica | | 2 |
| Cardamine pentaphyllos | peterolistna konopnica | | 4 |
| Cardamine pratensis | travniška penuša | | 4 |
| Cardamine pratensis | | | 4 |
| Cardamine resedifolia | katančevolistna penuša | | 1 |
| Cardamine trifolia | trilistna penuša | | 3 |
| Cardamine waldsteinii | zasavska konopnica | | 5 |
| Carduelis carduelis | lišček | štiglec, osatni lisec, osatica, špeglavec, stričoka | 5 |
| Carduelis chloris | zelenec | zelenček, zeleni dlesk, konopka | 2 |
| Carduelis spinus | čižek | olšica, cizek, konopljičica, navadni cizek, cajzeljc, šterlinc, penkica, ternjovka | 1 |
| Carduus sp. | bodak | | 4 |
| Carex acutiformis | ostroluski šaš | | 2 |
| Carex brizoides | migalični šaš | | 7 |
| Carex × danielis (C. flacca ssp. flacca × tomentosa) | | | 3 |
| Carex davalliana | srhki šaš | | 4 |
| Carex echinata | bodičnati šaš | | 1 |
| Carex elata | togi šaš | | 8 |
| Carex elongata | podaljšani šaš | | 2 |
| Carex ferruginea | rjastorjavi šaš | | 1 |
| Carex flacca | sinjezeleni šaš | | 1 |
| Carex hirta | dlakavi šaš | | 1 |
| Carex liparocarpos | bleščeči šaš | | 2 |
| Carex michelii | Michelijev šaš | | 1 |
| Carex montana | gorski šaš | | 2 |
| Carex otrubae | podlesni šaš | | 1 |
| Carex ovalis | zajčji šaš | | 2 |
| Carex pallescens | bledi šaš | | 2 |
| Carex panicea | proseni šaš | | 1 |
| Carex pendula | previsni šaš | | 4 |
| Carex pilosa | vejicati šaš | | 2 |
| Carex pilulifera | obloplodni šaš | | 2 |
| Carex remota | mlahavi šaš | | 2 |
| Carex riparia | obrežni šaš | | 1 |
| Carex rostrata | kljunasti šaš | | 1 |
| Carex sp. | šaš | | 26 |
| Carex tomentosa | polstenoplodni šaš | | 4 |
| Carex vesicaria | mehurjasti šaš | | 6 |
| Carex vulpina | lisičjerepi šaš | | 2 |
| Carex vulpina agg. | skupina lisičjerepega šaša | | 3 |
| Carlina acaulis | bodeča neža | | 6 |
| Carlina vulgaris | navadna kompava | | 1 |
| Carlina vulgaris | navadna kompava | | 3 |
| Carlina vulgaris ssp. brevibracteata | | | 1 |
| Carlina vulgaris ssp. vulgaris | | | 2 |
| Carpinus betulus | navadni gaber | | 9 |
| Carterocephalus palaemon | lisasti debeloglavec | lisasti debeloglavec | 3 |
| Cassida viridis | zeleni čeladnik | | 1 |
| Castanea sativa | pravi kostanj | | 16 |
| Castor fiber | bober | | 64 |
| Catalpa bignonioides | navadni cigarovec | katalpa | 1 |
| Catocala sp. | trakarji | | 1 |
| Catoptria sp. | | | 1 |
| Celastrina argiolus | svetli krhlikar | | 7 |
| Centaurea cyanus | plavica | | 12 |
| Centaurea jacea agg. | skupina navadnega glavinca | | 1 |
| Centaurea montana | gorski glavinec | | 2 |
| Centaurea montana agg. | skupina gorskega glavinca | | 2 |
| Centaurea rhenana | renski glavinec | | 2 |
| Centaurea rupestris | skalni glavinec | | 1 |
| Centaurea scabiosa ssp. fritschii | Fritschev glavinec | | 2 |
| Centaurea triumfettii | triumffetijev glavinec | | 1 |
| Centaurea uniflora ssp. nervosa | | | 1 |
| Centaurium erythraea | navadna tavžentroža | | 3 |
| Cephalanthera damasonium | bleda naglavka | | 5 |
| Cephalanthera longifolia | dolgolistna naglavka | | 11 |
| Cephalanthera rubra | rdeča naglavka | | 6 |
| Cerambycidae | Kozlički | | 6 |
| Cerambyx cerdo | strigoš (hrastov kozliček, veliki hrastov kozliček | | 1 |
| Cerambyx scopolii | Skopolijev kozliček, mali hrastov kozliček | | 1 |
| Cerapteryx graminis | | | 1 |
| Cerastis rubricosa | | | 1 |
| Cerastium strictum | toga smiljka | | 1 |
| Cerastium subtriflorum | soška smiljka | | 2 |
| Cerastium tenoreanum | Tenorejeva smiljka | | 1 |
| Cerastium tomentosum | polstena smiljka | | 2 |
| Cercis siliquastrum | navadni jadikovec | | 2 |
| Ceriagrion tenellum | rdeči voščenec | | 2 |
| Cerinthe minor | mala voščica | | 1 |
| Cerura vinula | vilar | | 1 |
| Cervus elaphus | navadni jelen | | 2 |
| Ceterach javorkeanum | javorkova slatinka | | 3 |
| Ceterach officinarum | navadna slatinka | | 3 |
| Cetonia aurata | zlata minica | | 7 |
| Chalcolestes viridis compl. | | | 1 |
| Chamaecyparis sp. | pacipresa | | 1 |
| Chamaecytisus hirsutus | dlakava relika | | 1 |
| Chamaecytisus purpureus | rdeča relika | | 3 |
| Chamaecytisus sp. | relika | | 3 |
| Chamaenerion angustifolium | ozkolistno ciprje | | 2 |
| Chamaespartium sagittale | navadna prevezanka | | 3 |
| Chamerion dodonaei | močvirsko ciprje | | 3 |
| Characeae | parožnice | | 1 |
| Charanyca trigrammica | | | 1 |
| Chara sp. | | | 9 |
| Chazara briseis | puščavar | skalni puščavar | 5 |
| Chelidonium majus | krvavi mlečnik | | 3 |
| Chenopodium ficifolium | smokvolistna metlika | | 1 |
| Chenopodium polyspermum | mnogosemenska metlika | | 1 |
| Cherax quadricarinatus | rdečeškarjevec | | 2 |
| Chiasmia clathrata | | | 2 |
| Chionea sp. | snežne muhe | | 1 |
| Chironomidae | Trzače | | 1 |
| Chiroptera | Netopirji | | 3 |
| Chloroclysta citrata | | | 1 |
| Chloroclysta siterata | | | 1 |
| Chloroperla sp. | | | 2 |
| Chondrostoma nasus | podust | | 29 |
| Chrysomela populi | topolovka | | 1 |
| Chrysomelidae | Lepenci | | 2 |
| Chrysopogon gryllus | zlatolaska | | 5 |
| Chrysosplenium alternifolium | premenjalnolistni vraničnik | | 2 |
| Cicadatra atra | črni škržad | | 1 |
| Cicerbita alpina | navadna gorska ločika | | 2 |
| Cichoriaceae | Radičevke | | 1 |
| Cichorium intybus | navadni potrošnik | | 4 |
| Cicindela hybrida | | | 1 |
| Cicindela silvicola | gozdni brzec | | 1 |
| Ciconia ciconia | bela štorklja | štrk, bogdal, roda, žabogolt, štrok | 88 |
| Ciconia nigra | črna štorklja | | 3 |
| Cimicidae | Zajedavske stenice | | 1 |
| Cinclus cinclus | povodni kos | vodni kos | 1 |
| Circaea lutetiana | veliki nadlišček | | 3 |
| Cirsium acaule | brezstebelni osat | | 2 |
| Cirsium arvense | njivski osat | | 2 |
| Cirsium eriophorum | volnatoglavi osat | | 4 |
| Cirsium oleraceum | mehki osat | | 4 |
| Cirsium palustre | močvirski osat | | 1 |
| Cirsium pannonicum | panonski osat | | 2 |
| Cirsium rivulare | potočni osat | | 5 |
| Cirsium spinosissimum | trnati osat | | 2 |
| Cirsium vulgare | navadni osat | | 1 |
| Cladium mariscus | navadna rezika | | 7 |
| Cleistogenes serotina | jesenski togobil | | 2 |
| Clematis alpina | planinski srobot | | 7 |
| Clematis integrifolia | celolistni srobot | | 3 |
| Clematis recta | pokončni srobot | | 2 |
| Clematis vitalba | navadni srobot | | 7 |
| Clematis viticella | južni srobot | | 4 |
| Cleora cinctaria | | | 1 |
| Clethrionomys glareolus | gozdna voluharica | | 1 |
| Clinopodium vulgare | navadna mačja zel | | 2 |
| Clostera curtula | | | 1 |
| Cobitis bilineata | primorska nežica | | 8 |
| Cobitis elongata | velika nežica | | 15 |
| Cobitis elongatoides | navadna nežica | polžača | 22 |
| Cobitis sp. | nežice | | 3 |
| Coccidae | Kaparji | | 1 |
| Coccinella septempunctata | sedempikčasta polonica (sedempika pikapolonica, pi | | 1 |
| Coccinellidae | Polonice (Pikapolonice) | | 10 |
| Coccothraustes coccothraustes | dlesk | debeloglaavi dlesk, luskavec, glavač, dlek | 1 |
| Coeloglossum viride | zeleni volčji jezik | | 1 |
| Coenagrion ornatum | koščični škratec | | 7 |
| Coenagrion puella | travniški škratec | | 27 |
| Coenagrion pulchellum | suhljati škratec | | 2 |
| Coenagrion scitulum | povodni škratec | | 9 |
| Coenonympha arcania | grmiščni okarček | | 11 |
| Coenonympha gardetta | gorski okarček | | 3 |
| Coenonympha glycerion | travniški okarček | belolisi okarček | 7 |
| Coenonympha oedippus | barjanski okarček | | 7 |
| Coenonympha pamphilus | mali okarček | | 10 |
| Coenonympha tullia | munčev okarček | | 2 |
| Colchicum autumnale | jesenski podlesek | | 6 |
| Coleoptera | Hrošči | | 22 |
| Colias alfacariensis | rumeni senožetnik | | 7 |
| Colias croceus | navadni senožetnik | postiljon | 10 |
| Colias erate | vzhodni senožetnik | | 1 |
| Colias hyale | bledi senožetnik | | 5 |
| Colias myrmidone | bakreni senožetnik | | 4 |
| Colias sp. | | | 2 |
| Collembola | Skakači | | 1 |
| Colocasia coryli | | | 1 |
| Colostygia pectinataria | | | 3 |
| Columba livia | skalni golob | divji golob, brezni golob | 2 |
| Columba livia domestica | domači golob | mestni golob | 9 |
| Columba palumbus | grivar | golob grivar, grivnjač, grivnik, veliki golob, veliki divji golob | 1 |
| Columba sp. | golobi | | 1 |
| Colutea arborescens | drevesasta mehurka | | 5 |
| Commelina communis | navadna komelina | | 3 |
| Conistra vaccinii | | | 1 |
| Consolida ajacis | vrtna ostrožica | | 1 |
| Convallaria majalis | šmarnica | | 9 |
| Convolvulus arvensis | njivski slak | | 2 |
| Conyza canadensis | kanadska hudoletnica | | 2 |
| Cordulegaster bidentata | povirni studenčar | mačkov studenčar, zamokov studenčar | 18 |
| Cordulegaster heros | veliki studenčar | prodni studenčar | 74 |
| Cordulegaster sp. | studenčar | | 19 |
| Cordulia aenea | močvirski lebduh | | 8 |
| Cornus mas | rumeni dren | | 13 |
| Cornus sanguinea | rdeči dren | | 10 |
| Coronella austriaca | smokulja | | 10 |
| Cortusa matthioli | Matthiolijeva kortuzovka | | 1 |
| Corvus frugilegus | poljska vrana | poljski vran, črna poljska vrana, črna vrana | 6 |
| Corvus monedula | kavka | kavka vran, rajka | 3 |
| Corydalis cava | votli petelinček | | 10 |
| Corydalis ochroleuca | bledorumeni petelinček | | 1 |
| Corydalis solida | čvrsti petelinček | | 2 |
| Corylus avellana | navadna leska | | 6 |
| Corythucha ciliata | platanina čipkarka | | 1 |
| Cosmia trapezina | trapezna sovka | | 1 |
| Cosmos bipinnatus | pernatolistna kozmeja | | 1 |
| Cossus cossus | vrbov lesovrt (vrbar, vrbov zavrtač) | | 2 |
| Cotinus coggygria | navadni ruj | | 12 |
| Cotoneaster integerrimus | navadna panešplja | | 1 |
| Cottus gobio | navadni kapelj | glavač, menkič, kapelj | 55 |
| Craniophora ligustri | | | 1 |
| Crataegus laevigata | navadni glog, beli trn | | 8 |
| Crataegus monogyna | enovratni glog | | 1 |
| Crataegus sp. | glog | | 16 |
| Crex crex | kosec | hrastač, hariš, strgar, hrastar, hareč, travniški kosec, hrečmon, krečlik, krac, krevs, krkljica | 2 |
| Crocothemis erythraea | opoldanski škrlatec | | 11 |
| Crocus reticulatus | progasti žafran | | 5 |
| Crocus vernus | pomladanski žafran | | 12 |
| Crocus vernus ssp. albiflorus | beli žafran | | 9 |
| Crocus vernus ssp. vernus | pomladanski žafran | | 4 |
| Cruciata glabra | gola dremota | | 3 |
| Cruciata laevipes | navadna dremota | | 2 |
| Crustacea | Raki | | 1 |
| Ctenocephalides canis | pasja bolha | | 1 |
| Ctenocephalides felis | mačja bolha | | 1 |
| Ctenopharyngodon idella | beli amur | | 2 |
| Cucujus cinnaberinus | škrlatni kukuj | | 1 |
| Cucullia sp. | | | 1 |
| Cuculus canorus | kukavica | navadna kukavica, siva kukavica, rjava kukavica | 1 |
| Cucumis sativus | navadna kumara | | 1 |
| Cucurbita pepo | navadna buča | | 1 |
| Culicidae | Komarji | | 1 |
| Cupido alcetas | kratkorepi kupido | modri kratkorepec | 4 |
| Cupido argiades | rumenooki kupido | rumenooki kratkorepec | 15 |
| Cupido decolorata | bledi kupido | brezoki kratkorepec | 3 |
| Cupido minimus | mali kupido | | 14 |
| Cupido sp. | | | 1 |
| Cupressus sempervirens | vednozelena cipresa | | 3 |
| Curculionidae | Rilčkarji | | 6 |
| Curculio nucum | lešnikar | | 1 |
| Curculio sp. | | | 1 |
| Cuscuta sp. | predenica | | 3 |
| Cychrus attenuatus | ozkovrati krešič (rjavi cihrus) | | 2 |
| Cyclamen purpurascens | navadna ciklama | | 5 |
| Cyclophora linearia | | | 1 |
| Cyclophora punctaria | | | 1 |
| Cygnus atratus | črni labod | | 2 |
| Cygnus olor | labod grbec | nemi labod, domači labod, rdečokljunasti labud | 26 |
| Cymatophorina diluta | | | 1 |
| Cymbalaria muralis | zidni poponec | | 2 |
| Cynoglossum officinale | navadni pasji jezik | | 2 |
| Cyperus fuscus | črnordeča ostrica | | 5 |
| Cyperus longus | dolgolistna ostrica | | 3 |
| Cyperus sp. | ostrica | | 1 |
| Cyprinidae | Krapovci | | 5 |
| Cyprinus carpio | krap | | 7 |
| Cyprinus carpio (koi krap) | | | 1 |
| Cypripedium calceolus | lepi čeveljc | | 10 |
| Dactylorhiza incarnata | mesnordeča prstasta kukavica | | 4 |
| Dactylorhiza maculata agg. | skupina pegaste prstaste kukavice | | 1 |
| Dactylorhiza maculata ssp. fuchsii | fuchsova prstasta kukavica | | 9 |
| Dactylorhiza maculata ssp. maculata | pegasta prstasta kukavica | | 1 |
| Dactylorhiza sambucina | bezgova prstasta kukavica | | 8 |
| Dactylorhiza sp. | prstasta kukavica | | 5 |
| Dactylorhiza traunsteineri | Traunsteinerjeva prstasta kukavica | | 2 |
| Daphne alpina | alpski volčin | | 2 |
| Daphne blagayana | Blagajev volčin | | 2 |
| Daphne cneorum | dišeči volčin | | 17 |
| Daphne laureola | lovorolistni volčin | | 10 |
| Daphne mezereum | navadni volčin | | 6 |
| Daphne striata | progasti volčin | | 1 |
| Datura stramonium | navadni kristavec | | 5 |
| Daucus carota | navadno korenje | | 3 |
| Deilephila elpenor | | | 3 |
| Deilephila porcellus | | | 3 |
| Delichon urbica | mestna lastovka | hišna lastovka, hišna lastovica, mala lastovka, mali hudournik, glastovca | 1 |
| Delphinium fissum | nacepljenolistni ostrožnik | | 1 |
| Dendrocopos major | veliki detel | pisana žolna | 4 |
| Dendrolimus pini | borova kokljica | | 1 |
| Dentex dentex | zobatec | | 1 |
| Deschampsia cespitosa | rušnata masnica | | 11 |
| Diachrysia chrysitis | | | 2 |
| Diachrysia tutti | | | 1 |
| Diacrisia sannio | travni medvedek | | 2 |
| Diaea dorsata | listni rakovičar | | 1 |
| Dianthus armeria | srhki klinček | | 2 |
| Dianthus barbatus | brkati klinček | | 2 |
| Dianthus carthusianorum | navadni nageljček, navadni klinček, kartavžar | | 3 |
| Dianthus collinus | hribski klinček | | 1 |
| Dianthus monspessulanus | montpellierski klinček | | 1 |
| Dianthus sanguineus | krvavordeči klinček | | 4 |
| Dianthus sternbergii | sternbergov nageljček, sternbergov klinček | | 4 |
| Dianthus sylvestris | divji klinček | | 2 |
| Dianthus sylvestris | divji klinček | | 2 |
| Diaphora mendica | | | 1 |
| Diarsia mendica | | | 1 |
| Dictamnus albus | navadni jesenček | | 12 |
| Digitalis grandiflora | velecvetni naprstec | | 3 |
| Diloba caeruleocephala | | | 5 |
| Diphasiastrum sp. | dvorednik | | 1 |
| Diplopoda | dvojnonoge | | 3 |
| Dipsacus fullonum | divja ščetica | | 10 |
| Dipsacus sp. | ščetica | | 1 |
| Diptera | Dvokrilci | | 1 |
| Diurnea fagella | bukova veščica | | 1 |
| Dolomedes fimbriatus | obvodni pajek | | 3 |
| Dolomedes sp. | | | 2 |
| Donacia sp. | | | 1 |
| Dorcadion arenarium | primorski poljski kozliček | | 1 |
| Dorcus parallelopipedus | mali rogač | | 8 |
| Doronicum austriacum | avstrijski divjakovec | | 2 |
| Doronicum grandiflorum | velecvetni divjakovec | | 2 |
| Draba aizoides | vednozelena gladnica | | 3 |
| Draba muralis | pozidna gladnica | | 1 |
| Dreissena polymorpha | potujoča trikotničarka | | 2 |
| Drosera intermedia | srednja rosika | | 7 |
| Drosera rotundifolia | okroglolistna rosika | | 15 |
| Dryas octopetala | alpska velesa | | 5 |
| Drymonia obliterata | | | 1 |
| Dryocopus martius | črna žolna | krekovt, kreka, kinkovec, klokar, mavrica | 2 |
| Dysstroma citrata | | | 1 |
| Dytiscidae | Kozaki | | 2 |
| Dytiscus dimidiatus | | | 1 |
| Dytiscus marginalis | obrobljeni kozak | | 5 |
| Ecballium elaterium | navadni štrkavec | | 4 |
| Echinocystis lobata | oljna bučka | | 13 |
| Echinops sphaerocephalus | oblasti bodoglavec | | 3 |
| Echium vulgare | navadni gadovec | | 4 |
| Ecliptopera capitata | | | 3 |
| Ectropis crepuscularia | | | 2 |
| Edraianthus graminifolius | travnolistna vrčica | | 1 |
| Egretta alba | velika bela čaplja | bela čaplja, srebrna čaplja, veliki beli rangar, veliki žabogolt, žabagolt | 2 |
| Elaphe longissima | gož (navadni gož) | | 10 |
| Eleocharis carniolica | kranjska sita | | 3 |
| Eleocharis palustris | močvirska sita | | 1 |
| Eleocharis palustris agg. | skupina močvirske site | | 1 |
| Eleocharis sp. | sita | | 4 |
| Eleusine indica | indijska prosenka | | 1 |
| Elodea canadensis | vodna kuga | | 2 |
| Elodea sp. | vodna kuga | | 1 |
| Ematurga atomaria | | | 2 |
| Emberiza citrinella | rumeni strnad | strnad | 3 |
| Emydidae | Sklednice | | 3 |
| Emys orbicularis | močvirska sklednica | | 2095 |
| Enallagma cyathigerum | bleščeči zmotec | | 4 |
| Endromis versicolora | brezov prelec | | 2 |
| Ephemera vulgata | navadna majevka | | 1 |
| Ephemeroptera | Enodnevnice | | 5 |
| Epilobium hirsutum | dlakavi vrbovec | | 3 |
| Epimedium alpinum | alpski vimček | | 9 |
| Epipactis atrorubens | temnordeča močvirnica | | 17 |
| Epipactis greuteri | Greuterjeva močvirnica | | 2 |
| Epipactis leptochila | ozkoustna močvirnica | | 3 |
| Epipactis microphylla | drobnolistna močvirnica | | 3 |
| Epipactis muelleri | Müllerjeva močvirnica | | 1 |
| Epipactis palustris | navadna močvirnica | | 30 |
| Epipactis purpurata | purpurna močvirnica | | 3 |
| Epipactis sp. | močvirnica | | 4 |
| Epipogium aphyllum | brezlistni nadbradec | | 2 |
| Epirrhoe alternata | | | 1 |
| Epirrhoe tristata | | | 1 |
| Epirrita sp. | | | 2 |
| Epitheca bimaculata | nosna jezerka | | 3 |
| Eptesicus serotinus | pozni netopir | | 45 |
| Equisetum arvense | njivska preslica | | 1 |
| Equisetum hyemale | zimska preslica | | 14 |
| Equisetum palustre | močvirska preslica | | 3 |
| Equisetum sp. | preslica | | 11 |
| Equisetum sylvaticum | gozdna preslica | | 2 |
| Equisetum telmateia | velika preslica | | 4 |
| Eranthis hyemalis | navadna jarica | | 5 |
| Erebia aethiops | gozdni rjavček | | 26 |
| Erebia calcaria | lorkovičev rjavček | Lorkovičev rjavček | 16 |
| Erebia epiphron | gorski rjavček | | 5 |
| Erebia euryale | svetlolisi rjavček | | 8 |
| Erebia gorge | skalni rjavček | | 4 |
| Erebia ligea | belololisi rjavček | | 7 |
| Erebia manto | rumenolisi rjavček | | 7 |
| Erebia medusa | pomladni rjavček | pomladanski rjavček | 13 |
| Erebia melas | črni rjavček | | 5 |
| Erebia oeme | svetlooki rjavček | okati rjavček | 4 |
| Erebia pandrose | laponski rjavček | | 5 |
| Erebia pharte | planinski rjavček | | 5 |
| Erebia pluto | triglavski rjavček | | 4 |
| Erebia pronoe | temni rjavček | | 10 |
| Erebia stirius | štajerski rjavček | | 4 |
| Erebia styx | trentarski rjavček | | 4 |
| Erica carnea | spomladanska resa | | 8 |
| Erigeron annuus | enoletna suholetnica | | 3 |
| Erinaceus concolor | beloprsi jež | | 7 |
| Eriogaster catax | hromi volnoritec | | 20 |
| Eriophorum angustifolium | ozkolistni munec | | 2 |
| Eriophorum latifolium | širokolistni munec | | 4 |
| Eriophorum scheuchzeri | Scheuchzerjev munec | | 2 |
| Eriophorum sp. | munec | | 21 |
| Eriopygodes imbecilla | | | 1 |
| Eriphia verrucosa | | | 1 |
| Erithacus rubecula | taščica | šmarnica, rdeča taščica, rdečegrla taščica, rumena taščica, babica | 1 |
| Eryngium alpinum | alpska možina | | 1 |
| Eryngium amethystinum | ametistasta možina | | 6 |
| Erynnis tages | nokotin sivček | črni debeloglavček | 4 |
| Erysimum carniolicum | kranjski šebenik | | 3 |
| Erythromma lindenii | prodni paškratec | | 3 |
| Erythromma najas | veliki rdečeokec | | 2 |
| Erythronium dens-canis | navadni pasji zob | | 10 |
| Esox lucius | ščuka | | 39 |
| Euchalcia variabilis | | | 4 |
| Euclidia glyphica | deteljna sovka | | 2 |
| Eudontomyzon vladykovi | donavski potočni piškur | | 54 |
| Euonymus europaea | navadna trdoleska | | 12 |
| Euonymus latifolia | širokolistna trdoleska | | 6 |
| Euonymus verrucosa | bradavičasta trdoleska | | 1 |
| Eupatorium cannabinum | konjska griva | | 58 |
| Euphorbia cyparissias | cipresasti mleček | | 1 |
| Euphorbia epithymoides | mnogobarvni mleček | | 4 |
| Euphorbia esula | ostri mleček | | 4 |
| Euphorbia lathyris | križnolistni mleček | | 3 |
| Euphorbia sp. | mleček | | 4 |
| Euphorbia verrucosa | bradavičasti mleček | | 4 |
| Euphrasia sp. | smetlika | | 1 |
| Euphydryas aurinia | travniški postavnež | grintavčev pisanček | 15 |
| Euphydryas intermedia | ruševni postavnež | | 4 |
| Euphydryas maturna | gozdni postavnež | | 10 |
| Eupithecia abietaria | | | 1 |
| Eupithecia gueneata | | | 1 |
| Eupithecia insigniata | | | 1 |
| Eupithecia linariata | | | 1 |
| Euplexia lucipara | | | 2 |
| Eupsilia transversa | | | 1 |
| Eurrhypara hortulata | | | 2 |
| Euthrix potatoria | | | 2 |
| Evergestis forficalis | | | 1 |
| Fabaceae | Metuljnice | | 3 |
| Fagopyrum esculentum | navadna ajda | | 3 |
| Fagus sylvatica | navadna bukev | bukev | 46 |
| Falco tinnunculus | postovka | navadna postovka, postova, mokosevka, postovka sokolič, postojka | 9 |
| Fallopia japonica | japonski dresnik | | 19 |
| Fallopia sp. | dresnik, slakovec | | 1 |
| Favonius quercus | modri hrastar | | 8 |
| Ferula galbanifera | | | 1 |
| Festuca sp. | bilnica | | 2 |
| Ficedula sp. | muharji | | 2 |
| Ficus carica | navadni smokvovec | | 1 |
| Filipendula ulmaria | brestovolistni oslad | | 16 |
| Filipendula vulgaris | navadni oslad | | 9 |
| Formicidae | Mravlje | | 7 |
| Fragaria moschata | muškatni jagodnjak | | 2 |
| Fragaria sp. | jagodnjak | | 2 |
| Fragaria vesca | navadni jagodnjak | | 5 |
| Fragaria viridis | zeleni jagodnjak | | 6 |
| Frangula alnus | navadna krhlika | | 4 |
| Frangula rupestris | skalna krhlika | | 3 |
| Fraxinus excelsior | veliki jesen | | 18 |
| Fraxinus ornus | mali jesen | | 9 |
| Fraxinus sp. | jesen | | 1 |
| Fringilla montifringilla | pinoža | nikiavec, ikavec, ček, čekel | 2 |
| Fritillaria meleagris | močvirska logarica | | 49 |
| Fulica atra | liska | vodna kokoška, plaska, tukalica, črna liska | 2 |
| Fumaria officinalis | navadna rosnica | | 1 |
| Fumaria officinalis | navadna rosnica | | 1 |
| Fumaria sp. | rosnica | | 1 |
| Fungi (= Mycota) | glive | | 46 |
| Gagea lutea | rumena pasja čebulica | | 6 |
| Gagea sp. | pasja čebulica | | 2 |
| Gagea spathacea | nožničava pasja čebulica | | 1 |
| Galanthus nivalis | navadni mali zvonček | | 15 |
| Galeobdolon argentatum | srebrna rumenka | | 2 |
| Galeobdolon montanum | gorska rumenka | | 2 |
| Galeobdolon sp. | rumenka | | 1 |
| Galeopsis speciosa | pisani zebrat | | 3 |
| Galinsoga parviflora | drobnocvetni rogovilček | | 1 |
| Galium aparine | plezajoča lakota | | 2 |
| Galium odoratum | dišeča lakota | | 1 |
| Galium sp. | lakota | | 2 |
| Galium uliginosum | barska lakota | | 1 |
| Galium verum | prava lakota, strdenka | | 2 |
| Gallinula chloropus | zelenonoga tukalica | tukalica, vodna kokoška, vodna putka, zelenonogast mlakož, mokuška z rdečo liso, mokuška z rumeno liso | 1 |
| Garrulus glandarius | šoja | navadna šoja, šoga, pšoga, irt, jert | 2 |
| Gastropoda | Polži | | 29 |
| Genista germanica | nemška košeničica | | 2 |
| Genista januensis | triroba košeničica | | 5 |
| Genista radiata | žarkasta košeničica | | 1 |
| Genista sp. | košeničica | | 3 |
| Gentiana asclepiadea | kokoševčevolistni svišč | svečnik | 8 |
| Gentiana clusii | clusijev svišč | | 3 |
| Gentiana cruciata | navzkrižnolistni svišč | | 7 |
| Gentiana lutea | košutnik | | 3 |
| Gentiana pannonica | panonski svišč | | 3 |
| Gentiana pneumonanthe | močvirski svišč | | 24 |
| Gentiana sp. | svišč | | 4 |
| Gentiana utriculosa | trebušasti svišč | | 2 |
| Gentiana verna | zaspanček | | 4 |
| Gentiana verna | spomladanski svišč | | 1 |
| Gentiana verna ssp. tergestina | tržaški svišč | | 2 |
| Gentiana verna ssp. verna | spomladanski svišč | | 1 |
| Gentianella ciliata | resasti sviščevec | | 4 |
| Gentianella germanica | nemški sviščevec | | 1 |
| Gentianella sp. | sviščevec | | 4 |
| Geometridae | Pedici | | 5 |
| Geotrupes stercorarius | navadni govnač | | 1 |
| Geotrupidae | Veliki govnači | | 3 |
| Geranium argenteum | srebrna krvomočnica | | 1 |
| Geranium dissectum | nacepljenolistna krvomočnica | | 1 |
| Geranium macrorrhizum | korenikasta krvomočnica | | 1 |
| Geranium palustre | močvirska krvomočnica | | 3 |
| Geranium phaeum | rjavordeča krvomočnica | | 10 |
| Geranium pratense | travniška krvomočnica | | 1 |
| Geranium robertianum | smrdljička | | 5 |
| Geranium sanguineum | krvavordeča krvomočnica | | 7 |
| Geranium sp. | krvomočnica | | 3 |
| Geranium sylvaticum | gozdna krvomočnica | | 2 |
| Gerris sp. | | | 1 |
| Geum montanum | gorska sretena | | 1 |
| Geum rivale | potočna sretena | | 2 |
| Geum urbanum | navadna sretena | | 1 |
| Gladiolus illyricus | ilirski meček | | 8 |
| Gladiolus sp. | meček | | 19 |
| Glaucopsyche alexis | grahovčev iskrivček | | 6 |
| Gleditsia sp. | gledičevka | | 1 |
| Gliridae | | | 1 |
| Glis glis | navadni polh | | 6 |
| Globularia cordifolia | srčastolistna mračica | | 7 |
| Globularia nudicaulis | golostebelna mračica | | 2 |
| Globularia punctata | navadna mračica | | 4 |
| Globularia sp. | mračica | | 1 |
| Glyceria maxima | velika sladika | | 1 |
| Glyceria sp. | sladika | | 1 |
| Glyceria striata | progasta sladika | | 1 |
| Gobio obtusirostris | navadni globoček | globoček | 55 |
| Gobio sp. | globočki | | 1 |
| Gomphidae | Porečniki | | 1 |
| Gomphus vulgatissimus | popotni porečnik | | 2 |
| Gonepteryx rhamni | citronček | | 10 |
| Goodyera repens | plazeča mrežolistnica | | 4 |
| Graphosoma lineatum | pižamarka | | 1 |
| Gratiola officinalis | navadna božja milost | | 2 |
| Grus grus | žerjav | sivi žerjav, žerjav, žrjav, gruh | 2 |
| Gryllotalpa gryllotalpa | navadni bramor | | 3 |
| Gyas titanus | Navádni velikánček | | 2 |
| Gymnadenia conopsea | navadni kukovičnik | | 32 |
| Gymnadenia conopsea ssp. densiflora | | | 3 |
| Gymnadenia odoratissima | dehteči kukovičnik | | 2 |
| Gymnocephalus baloni | grbasti okun | | 5 |
| Gymnocephalus cernua | navadni okun | | 4 |
| Gypsophila repens | plazeča sadrenka | | 2 |
| Habrosyne pyritoides | | | 1 |
| Hacquetia epipactis | navadno tevje | | 5 |
| Hacquetia epipactis | | | 6 |
| Hada plebeja | | | 1 |
| Haemopis sanguisuga | konjska pijavka | | 3 |
| Hamearis lucina | rjavi šekavček | rjavi marogar | 3 |
| Hedera helix | navadni bršljan | | 23 |
| Helianthemum sp. | popon | | 1 |
| Helianthus annuus | navadna sončnica | | 2 |
| Helianthus tuberosus | laška repa | | 8 |
| Helictotrichon pubescens | puhasta ovsika | | 1 |
| Heliosperma pusillum | četverozobi slanozor | | 1 |
| Heliothis sp. | | | 1 |
| Helix pomatia | veliki vrtni polž | | 7 |
| Helix sp. | | | 4 |
| Helleborus atrorubens | temnoškrlatni teloh | | 8 |
| Helleborus multifidus | deljenolistni teloh | | 1 |
| Helleborus multifidus ssp. istriacus | istrski teloh | | 3 |
| Helleborus niger | črni teloh | | 9 |
| Helleborus odorus | blagodišeči teloh | | 6 |
| Helleborus sp. | teloh | | 2 |
| Hemaris fuciformis | | | 1 |
| Hemerocallis fulva | rumenorjava maslenica | | 2 |
| Hemerocallis lilioasphodelus | rumena maslenica | | 28 |
| Hepatica nobilis | navadni jetrnik | | 6 |
| Heracleum austriacum ssp. siifolium | | | 1 |
| Herminia tarsicrinalis | | | 2 |
| Hesperia comma | biserni vejičar | biserni vejičar, biserni temnikar | 7 |
| Hesperis candida | bela nočnica | | 1 |
| Heteroptera | Stenice | | 16 |
| Heteropterus morpheus | temni poplesovalec | pisani poplesovalček | 4 |
| Hieracium aurantiacum | oranžna škržolica | | 4 |
| Hieracium bifidum | razcepljena škržolica | | 2 |
| Hieracium pilosella | dolgodlakava škržolica | | 4 |
| Hieracium villosum | kosmata škržolica | | 2 |
| Hierochloë australis | šmarna trava | | 5 |
| Hierophis viridiflavus | črnica | | 10 |
| Himantoglossum adriaticum | jadranska smrdljiva kukavica | | 23 |
| Himantopus himantopus | polojnik | rdečenogi polojnik, polojnik, štular, strelcar, črni strelcar | 2 |
| Hipparchia fagi | veliki gozdnik | | 4 |
| Hipparchia semele | rjasti gozdnik | | 5 |
| Hipparchia statilinus | primorski gozdnik | primorski konjar | 5 |
| Hippocrepis comosa | navadna podkvica | | 1 |
| Hippophae rhamnoides | navadni rakitovec | | 2 |
| Hippuris vulgaris | navadna smrečica | | 4 |
| Hirudinea | Pijavke | | 9 |
| Hirudo medicinalis | medicinska pijavka | | 4 |
| Hirundo rupestris | skalna lastovka | | 4 |
| Hirundo rustica | kmečka lastovka | kmetska lastovka, kmetiška lastovka, črna lastovka | 4 |
| Hister quadrimaculatus | | | 1 |
| Hladnikia pastinacifolia | rebrinčevolistna hladnikija | | 1 |
| Holcus lanatus | volnata medena trava | | 3 |
| Holoschoenus vulgaris | navadno bičevje | | 1 |
| Homogyne alpina | alpski planinšček | | 1 |
| Homogyne sylvestris | gozdni planinšček | | 1 |
| Hoplia farinosa | | | 2 |
| Hoplodrina octogenaria | | | 1 |
| Hoplodrina respersa | | | 1 |
| Horisme tersata | | | 2 |
| Horminum pyrenaicum | pirenejska zmajevka | | 1 |
| Hottonia palustris | vodna grebenika | | 16 |
| Hucho hucho | sulec | | 14 |
| Humulus lupulus | navadni hmelj | | 6 |
| Hydria cervinalis | | | 1 |
| Hydriomena furcata | | | 3 |
| Hydrocharis morsus-ranae | žabji šejek | | 5 |
| Hydrophilus piceus | črni potapnik | | 2 |
| Hydrous piceus | črni potapnik | | 3 |
| Hyla arborea | zelena rega | | 93 |
| Hylaea fasciaria prasinaria | | | 1 |
| Hyles euphorbiae | | | 1 |
| Hyles gallii | | | 1 |
| Hyloicus pinastri | | | 2 |
| Hymenoptera | Kožekrilci | | 8 |
| Hyoscyamus albus | beli zobnik | | 3 |
| Hypena rostralis | | | 1 |
| Hypericum montanum | gorska krčnica | | 1 |
| Hypericum perforatum | šentjanževka | | 2 |
| Hypericum sp. | krčnica | | 1 |
| Hypochoeris maculata | pegasti svinjak | | 2 |
| Hypochoeris radicata | navadni svinjak | | 1 |
| Hypomecis punctinalis | | | 1 |
| Hypomecis roboraria | | | 1 |
| Hyponephele lycaon | grmovni oblakar | | 4 |
| Hypsugo savii | Savijev netopir | | 5 |
| Hystrichopsylla (Hystrichopsylla) talpae | | | 1 |
| Ichthyosaura alpestris | planinski pupek | | 4 |
| Idaea aversata | | | 1 |
| Idaea subsericeata | | | 1 |
| Ilex aquifolium | navadna bodika | | 9 |
| Impatiens balfourii | balfourova nedotika | | 1 |
| Impatiens glandulifera | žlezava nedotika | | 27 |
| Impatiens noli-tangere | navadna nedotika | | 9 |
| Impatiens parviflora | drobnocvetna nedotika | | 2 |
| Inachis io | dnevni pavlinček | | 15 |
| Insecta | Žuželke | | 6 |
| Inula conyza | navadni oman | | 3 |
| Inula helenium | veliki oman | | 1 |
| Inula hirta | srhkodlakavi oman | | 3 |
| Iolana iolas | veliki mehurkar | | 1 |
| Iphiclides podalirius | jadralec | | 14 |
| Iris graminea | travnolistna perunika | | 4 |
| Iris pseudacorus | vodna perunika | | 24 |
| Iris sibirica | sibirska perunika | | 25 |
| Iris sp. | perunika | | 4 |
| Ischnura elegans | modri kresničar | | 17 |
| Ischnura pumilio | bledi kresničar | | 6 |
| Ischnura sp. | kresničar | | 3 |
| Isodontia mexicana | mehiška grebača | | 1 |
| Isopoda | Enakonožci, Mokrice | | 1 |
| Isopyrum thalictroides | navadna polžarka | | 5 |
| Isotomus speciosus | | | 1 |
| Issoria lathonia | pisana lesketavka | | 8 |
| Ixobrychus minutus | čapljica | mala bobnarica, mala čaplja, čapljica, mali rangarček | 1 |
| Ixodes (Eschatocephalus) vespertilionis | netopirski klop | | 1 |
| Ixodes (Ixodes) ricinus | gozdni klop | | 1 |
| Ixodidae | Pravi klopi | | 1 |
| Jovibarba hirta | srhkodlakavi netreskovec | | 4 |
| Juglans regia | navadni oreh | | 10 |
| Juncus articulatus | bleščečeplodno ločje | | 4 |
| Juncus bufonius | žabje ločje | | 2 |
| Juncus compressus | stisnjeno ločje | | 2 |
| Juncus effusus | navadno ločje | | 3 |
| Juncus jacquinii | jacquinovo ločje | | 2 |
| Juncus sp. | ločje | | 6 |
| Juniperus communis | navadni brin | | 3 |
| Juniperus communis | navadni brin | | 7 |
| Juniperus oxycedrus | rdečeplodni brin | | 1 |
| Knautia drymeia | ogrsko grabljišče | | 3 |
| Knautia sp. | grabljišče | | 2 |
| Laburnum alpinum | alpski nagnoj | | 1 |
| Lacerta agilis | martinček, siva kuščarica | | 27 |
| Lacerta viridis | zelenec | | 9 |
| Lacerta viridis/bilineata complex (Lacerta v. complex) | | | 41 |
| Lacertidae | kuščarice | | 4 |
| Lactuca perennis | trpežna ločika | | 3 |
| Laemostenus cavicola | | | 1 |
| Laemostenus schreibersi | veliki jamski brzec | | 2 |
| Lagria hirta | | | 1 |
| Lamia textor | črni kosec (tkalski kozliček) | | 3 |
| Lamium album | bela mrtva kopriva | | 1 |
| Lamium maculatum | lisasta mrtva kopriva | | 3 |
| Lamium orvala | velecvetna mrtva kopriva | | 5 |
| Lamium purpureum | škrlatnordeča mrtva kopriva | | 3 |
| Lampetra zanandreai | laški piškur | laški potočni piškur | 4 |
| Lampyridae | Kresnice | | 2 |
| Lanius collurio | rjavi srakoper | | 5 |
| Lanius excubitor | veliki srakoper | sivi srakoper | 2 |
| Larinioides sp. | | | 1 |
| Larix decidua | navadni macesen | | 19 |
| Larix sp. | macesen | | 1 |
| Larus ridibundus | rečni galeb | tonovščica, bela tonovščica, navadna tonovščica, rdečenoga tonovščica, beli galeb, navadni galeb | 1 |
| Larus sp. | galebi | | 3 |
| Laserpitium latifolium | širokolistni jelenovec | | 1 |
| Laserpitium siler | gorski jelenovec | ozkolistni jelenovec | 12 |
| Lasiocampa quercus | hrastova kokljica | | 6 |
| Lasiommata maera | veliki skalnik | | 11 |
| Lasiommata megera | okrasti skalnik | | 4 |
| Lasiommata petropolitana | planinski skalnik | | 6 |
| Laspeyria flexula | | | 2 |
| Lathraea squamaria | navadni lusnec | | 8 |
| Lathyrus latifolius | širokolistni grahor | | 2 |
| Lathyrus linifolius | gorski grahor | | 2 |
| Lathyrus occidentalis var. montanus | | | 1 |
| Lathyrus vernus | spomladanski grahor | | 3 |
| Laurus nobilis | navadni lovor | | 1 |
| Leersia oryzoides | navadna rižolica | | 2 |
| Legousia speculum-veneris | navadno njivno zrcalce | | 4 |
| Lemna gibba | grbasta vodna leča | | 10 |
| Lemna minor | mala vodna leča | | 10 |
| Lemna sp. | vodna leča | | 14 |
| Leontodon incanus | sivi jajčar | | 1 |
| Leontodon sp. | jajčar, otavčič | | 1 |
| Leontopodium alpinum | planika | | 6 |
| Lepidoptera | Metulji | | 68 |
| Lepisma sp. | | | 1 |
| Lepomis gibbosus | sončni ostriž | | 11 |
| Leptidea morsei | veliki frfotavček | | 4 |
| Leptidea sinapis/reali | | | 8 |
| Leptinotarsa decemlineata | koloradski hrošč, krompirjevec | | 4 |
| Leptoglossus occidentalis | storževa listonožka | | 1 |
| Leptotes pirithous | modri marogarček | | 4 |
| Leptura rubra | opečnordeči vitki kozliček | | 3 |
| Lepus europaeus | poljski zajec | | 3 |
| Lestes barbarus | grmiščna zverca | | 3 |
| Lestes dryas | obrežna zverca | | 1 |
| Lestes sp. | zverca | | 4 |
| Lestes sponsa | obvodna zverca | | 5 |
| Lestes virens | loška zverca | | 3 |
| Leucanthemum sp. | ivanjščica | | 9 |
| Leuciscus idus | jez | | 2 |
| Leuciscus leuciscus | klenič | | 1 |
| Leucojum aestivum | poletni veliki zvonček | | 25 |
| Leucojum vernum | pomladanski veliki zvonček | | 19 |
| Leucoma salicis | | | 1 |
| Leucorrhinia dubia | barjanski spreletavec | | 4 |
| Libelloides macaronius | navadna metuljčnica | | 11 |
| Libellula depressa | modri ploščec | | 31 |
| Libellula fulva | črni ploščec | | 8 |
| Libellula quadrimaculata | lisasti ploščec | | 7 |
| Libellula sp. | ploščec | | 1 |
| Libythea celtis | koprivovčev nosar | koprivovček | 3 |
| Lichenes | | | 1 |
| Lichia amia | lica | | 1 |
| Ligdia adustata | | | 1 |
| Ligustrum vulgare | navadna kalina | | 4 |
| Lilioceris sp. | | | 1 |
| Lilium bulbiferum | brstična lilija | | 12 |
| Lilium carniolicum | kranjska lilija | | 14 |
| Lilium martagon | turška lilija | zlati klobuk | 9 |
| Limenitis camilla | mali trepetlikar | | 4 |
| Limenitis populi | veliki trepetlikar | | 4 |
| Limenitis reducta | modri trepetlikar | | 10 |
| Limodorum abortivum | navadna splavka | | 2 |
| Limoniidae | Limonide | | 1 |
| Linaria alpina | alpska madronščica | | 3 |
| Linaria sp. | madronščica | | 1 |
| Linaria vulgaris | navadna madronščica | | 2 |
| Linum flavum | rumeni lan | | 2 |
| Linum flavum agg. | skupina rumenega lanu | | 2 |
| Linum narbonense | francoski lan | | 4 |
| Linum sp. | lan | | 6 |
| Linum tenuifolium | drobnolistni lan | | 1 |
| Linum viscosum | lepljivi lan | | 2 |
| Liparis loeselii | loeselijeva grezovka | | 5 |
| Liparus sp. | | | 1 |
| Liriodendron tulipifera | navadni tulipanovec | | 3 |
| Lissotriton sp./Ichthyosaura sp. | mali pupki | | 5 |
| Lissotriton vulgaris | navadni pupek | | 56 |
| Lissotriton vulgaris meridionalis | | | 6 |
| Lissotriton vulgaris vulgaris | | | 1 |
| Listera ovata | jajčastolistni muhovnik | | 13 |
| Lithophane consocia | | | 1 |
| Lithosia quadra | | | 3 |
| Lithospermum sp. | železnik | | 4 |
| Lloydia serotina | lojdija | | 4 |
| Lolium multiflorum | laška ljuljka | | 1 |
| Lomaspilis marginata | | | 1 |
| Lomographa bimaculata | | | 1 |
| Lonicera alpigena | planinsko kosteničevje | | 1 |
| Lonicera caprifolium | kovačnik | | 9 |
| Lonicera xylosteum | puhastolistno kosteničevje | | 8 |
| Lopinga achine | scopolijev zlatook | Scopolijev okar | 7 |
| Loranthus europaeus | navadno ohmelje | | 5 |
| Lota lota | menek | | 2 |
| Lotus corniculatus | navadna nokota | | 3 |
| Lucanus cervus | rogač | | 14 |
| Lumbricidae | | | 1 |
| Lunaria rediviva | trpežna srebrenka | | 5 |
| Lutra lutra | vidra | | 11 |
| Luzula campestris | poljska bekica | | 1 |
| Luzula campestris agg. | skupina poljske bekice | | 1 |
| Luzula luzuloides | belkasta bekica | | 2 |
| Lycaena alciphron | spreminjavi cekinček | | 4 |
| Lycaena dispar | močvirski cekinček | barjanski cekinček | 26 |
| Lycaena hippothoe | škrlatni cekinček | | 8 |
| Lycaena phlaeas | mali cekinček | | 7 |
| Lycaena tityrus | temni cekinček | | 12 |
| Lycaena virgaureae | zlati cekinček | | 10 |
| Lychnis flos-cuculi | kukavičja lučca | | 15 |
| Lychnis viscaria | navadna lučca | | 2 |
| Lycia alpina | | | 1 |
| Lycia hirtaria | | | 1 |
| Lycopodium annotinum | brinolistni lisičjak | | 2 |
| Lycopodium sp. | lisičjak | | 1 |
| Lycosidae | Volkci | | 1 |
| Lygephila craccae | | | 2 |
| Lymantria dispar | navadni gobar | | 3 |
| Lymantria monacha | smrekov gobar | | 1 |
| Lymnaea stagnalis | veliki mlakar | | 1 |
| Lynx lynx | ris (navadni ris) | | 1 |
| Lysimachia nemorum | podlesna pijavčnica | | 2 |
| Lysimachia nummularia | okroglolistna pijavčnica | | 2 |
| Lysimachia punctata | pikasta pijavčnica | | 2 |
| Lysimachia vulgaris | navadna pijavčnica | | 8 |
| Lythrum salicaria | navadna krvenka | | 6 |
| Macroglossum stellatarum | velerilec | | 2 |
| Macrolepidoptera | | | 1 |
| Macrolepiota procera | | | 1 |
| Macrothylacia rubi | | | 2 |
| Maianthemum bifolium | dvolistna senčnica | | 4 |
| Malacosoma neustria | prstančar | | 2 |
| Malus domestica | jablana | | 6 |
| Malva sp. | slezenovec | | 3 |
| Malva sylvestris | gozdni slezenovec | | 2 |
| Mammalia | Sesalci | | 1 |
| Maniola jurtina | navadni lešnikar | lešnikar | 22 |
| Mantis religiosa | navadna bogomolka | | 11 |
| Marchantiaceae | | | 3 |
| Marchantia polymorpha | | | 1 |
| Marmota marmota | alpski svizec | | 2 |
| Marsilea quadrifolia | štiriperesna marzilka | | 3 |
| Martes foina | kuna belica | | 1 |
| Matteuccia struthiopteris | navadna peruša | | 21 |
| Megaptera novaeangliae | kit grbavec | | 6 |
| Melampyrum arvense | poljski črnilec | | 2 |
| Melampyrum cristatum | češljasti črnilec | | 1 |
| Melampyrum nemorosum | podlesni črnilec | | 2 |
| Melampyrum pratense | navadni črnilec | | 1 |
| Melampyrum sp. | črnilec | | 1 |
| Melanargia galathea | navadni lisar | travniški lisar | 13 |
| Melanchra persicariae | | | 1 |
| Melanthia procellata | | | 1 |
| Meles meles | jazbec | | 3 |
| Melica nutans agg. | skupina previsne kraslike | | 1 |
| Melica picta | pisana kraslika | | 1 |
| Melilotus albus | bela medena detelja | | 1 |
| Melitaea athalia | navadni pisanček | | 28 |
| Melitaea aurelia | jetičnikov pisanček | | 11 |
| Melitaea britomartis | temni pisanček | | 8 |
| Melitaea cinxia | pikasti pisanček | | 5 |
| Melitaea diamina | močvirski pisanček | | 7 |
| Melitaea didyma | rdeči pisanček | | 24 |
| Melitaea phoebe | veliki pisanček | | 14 |
| Melitaea sp. | | | 3 |
| Melitaea trivia | lučnikov pisanček | | 1 |
| Melittis melissophyllum | navadna medenika | | 10 |
| Meloe sp. | | | 1 |
| Meloe violaceus | vijoličasta travnica | | 1 |
| Melolontha melolontha | majski hrošč | poljski rjavi hrošč | 2 |
| Mentha aquatica | vodna meta | | 2 |
| Mentha longifolia | dolgolistna meta | | 3 |
| Mentha sp. | meta | | 1 |
| Menyanthes trifoliata | navadni mrzličnik | | 9 |
| Mercurialis perennis | trpežni golšec | | 1 |
| Mergellus albellus | mali žagar | mala žagarica, mali potapljavec, belič, mali žagar | 1 |
| Mergus merganser | veliki žagar | velika žagarica, veliki potapljavec, veliki žagar, velika savščica, ribič | 3 |
| Merops apiaster | čebelar | legat, bčelar, čebelojedec, detelj | 5 |
| Mesoleuca albicillata | | | 1 |
| Mesotriton alpestris | planinski pupek | | 28 |
| Mespilus germanica | navadna nešplja | | 2 |
| Meta menardi | navadni čeljustar | | 1 |
| Metasequoia glyptostroboides | metasekvoja | | 1 |
| Meta sp. | | | 1 |
| Microlepidoptera | | | 1 |
| Micrommata virescens | zeleni pajek | | 1 |
| Micropterus salmoides | postrvji ostriž | | 2 |
| Miltochrista miniata | | | 3 |
| Mimas tiliae | | | 2 |
| Miniopterus schreibersii | dolgokrili netopir | | 66 |
| Minois dryas | žametni modrook | | 10 |
| Miramella irena | bukova kobilica | | 1 |
| Misgurnus fossilis | činklja | | 8 |
| Misumena vatia | cvetni pajek (kameleonski rakovičar) | | 2 |
| Mniotype adusta | | | 2 |
| Moehringia muscosa | mahovna popkoresa | | 1 |
| Moenchia mantica | peteroštevna prženka | | 3 |
| Molinia arundinacea | trstikasta stožka | | 1 |
| Molinia caerulea | modra stožka | | 18 |
| Molinia caerulea ssp. arundinacea | trstikasta stožka | | 4 |
| Molops striolatus | | | 1 |
| Moma alpium | | | 1 |
| Monochamus sartor | veliki smrekov kozliček (krojaček) | | 1 |
| Monotropa hypophegea | goli samovratec | | 1 |
| Monotropa hypopitys agg. | skupina dlakavega samovratca | | 1 |
| Monotropa sp. | samovratec | | 1 |
| Morimus funereus | bukov kozliček | | 15 |
| Mormo maura | črni trakar | | 1 |
| Morus alba | bela murva | | 1 |
| Morus nigra | črna murva | | 4 |
| Motacilla alba | bela pastirica | navadna pastirica, pastirica, pliska, tresorepka, vrtorepka, pastiričica, črna pastirica, fliska | 1 |
| Muridae | | | 1 |
| Muscardinus avellanarius | podlesek | | 4 |
| Muscari botryoides | jagodasta hrušica | | 4 |
| Muscari comosum | čopasta hrušica | | 6 |
| Muscari neglectum | grozdasta hrušica | | 3 |
| Muscari sp. | hrušica | | 1 |
| Mustela putorius | dihur | | 1 |
| Myocastor coypus | nutrija | bobrovka | 29 |
| Myosotis alpestris | planinska spominčica | | 2 |
| Myosotis scorpioides | močvirska spominčica | | 1 |
| Myosotis sp. | spominčica | | 1 |
| Myotis alcathoe | nimfin netopir | | 2 |
| Myotis bechsteinii | velikouhi (veliki navadni netopir) | | 25 |
| Myotis blythii | ostrouhi netopir | | 11 |
| Myotis brandtii | Brandtov netopir | | 7 |
| Myotis capaccinii | dolgonogi netopir | | 11 |
| Myotis daubentonii | obvodni netopir | | 24 |
| Myotis daubentonii/capaccinii | obvodni/dolgonogi netopir | | 4 |
| Myotis emarginatus | vejicati netopir | | 91 |
| Myotis myotis | navadni netopir | | 132 |
| Myotis myotis/blythii | | | 127 |
| Myotis mystacinus | brkati netopir | | 10 |
| Myotis mystacinus/brandtii | brkati/Brandtov netopir | | 1 |
| Myotis mystacinus s.lat. | skupina brkatega netopirja | | 4 |
| Myotis nattereri | resasti netopir | | 14 |
| Myriophyllum sp. | rmanec | | 2 |
| Myriophyllum spicatum | klasasti rmanec | | 10 |
| Myriophyllum verticillatum | vretenčasti rmanec | | 3 |
| Mythimna sp. | | | 1 |
| Najas minor | mala podvodnica | | 1 |
| Narcissus poeticus | beli narcis | | 23 |
| Nardus stricta | volk | | 27 |
| Nasturtium officinale | navadna vodna kreša | | 3 |
| Natrix natrix | belouška | | 74 |
| Natrix sp. | | | 4 |
| Natrix tessellata | kobranka | | 49 |
| Nematomorpha | žive niti | | 6 |
| Neomys fodiens | povodna rovka | | 1 |
| Neottia nidus-avis | rjava gnezdovnica | | 6 |
| Nepa cinerea | Vodni ščipalec | | 2 |
| Neptis rivularis | veliki kresničar | | 8 |
| Neptis sappho | mali kresničar | | 5 |
| Nicrophorus vespilloides | | | 1 |
| Nigella damascena | vzhodna črnika | | 1 |
| Nigritella lithopolitanica | kamniška murka | | 3 |
| Nigritella rhellicani | črna murka | | 4 |
| Noctua pronuba | | | 2 |
| Noctuidae | Sovke | | 3 |
| Notodonta dromedarius | | | 1 |
| Notodonta ziczac | cikcakasta hrbtorožka | | 1 |
| Notonecta sp. | | | 1 |
| Nuctenea umbratica | | | 2 |
| Nuphar lutea | rumeni blatnik | | 25 |
| Nyctalus leisleri | gozdni mračnik | | 2 |
| Nyctalus noctula | navadni mračnik | | 27 |
| Nycterosea obstipata | | | 1 |
| Nymphaea alba | beli lokvanj | | 3 |
| Nymphaea sp. | lokvanj | | 6 |
| Nymphalidae | Pisančki | | 1 |
| Nymphalis antiopa | pogrebec | | 6 |
| Nymphalis polychloros | veliki lepotec | | 4 |
| Nymphalis vaualbum | vzhodni lepotec | | 2 |
| Nymphalis xanthomelas | pisani lepotec | | 2 |
| Nymphoides peltata | ščitolistna močvirka | | 3 |
| Ochlodes sylvanus | rjasti vihravček | | 12 |
| Ochropacha duplaris | | | 1 |
| Ochropleura plecta | | | 3 |
| Odonata | Kačji pastirji | | 9 |
| Odonestis pruni | | | 1 |
| Odontites vernus ssp. vernus | | | 1 |
| Odontopera bidentata | | | 1 |
| Odontosia carmelita | | | 1 |
| Oecanthus pellucens | čriček | | 2 |
| Oeceoptoma thoracica | rdečevrati mrhar | | 1 |
| Oedemeridae | | | 1 |
| Oenanthe aquatica | vodni sovec | | 2 |
| Oenothera biennis | dvoletni svetlin | | 2 |
| Olea europaea | | | 1 |
| Oligochaeta | Maloščetinci | | 3 |
| Omphalodes verna | spomladanska torilnica | | 6 |
| Oncorhynchus mykiss | šarenka | amerikanka, kalifornijska postrv | 16 |
| Onobrychis viciifolia | navadna turška detelja | | 2 |
| Ononis arvensis | njivski gladež | | 1 |
| Onopordum sp. | kozjica | | 1 |
| Onychogomphus forcipatus | bledi peščenec | | 16 |
| Onychogomphus forcipatus forcipatus | | | 1 |
| Ophioglossum vulgatum | navadni kačji jezik | | 2 |
| Ophiogomphus cecilia | kačji potočnik | | 21 |
| Ophrys apifera | čebeljeliko mačje uho | | 1 |
| Ophrys holosericea | čmrljeliko mačje uho | | 14 |
| Ophrys insectifera | muholiko mačje uho | | 4 |
| Ophrys sphegodes | osjeliko mačje uho | | 22 |
| Ophrys sphegodes | osjeliko mačje uho | | 18 |
| Opiliones | Suhe južine | | 11 |
| Opilio saxatilis | Skálni matíja | | 1 |
| Opisthograptis luteolata | | | 1 |
| Orchidaceae | Kukavičevke | | 12 |
| Orchis coriophora | steničja kukavica | | 3 |
| Orchis mascula | stasita kukavica | | 3 |
| Orchis militaris | čeladasta kukavica | | 31 |
| Orchis morio | navadna kukavica | | 40 |
| Orchis pallens | bleda kukavica | | 2 |
| Orchis palustris | močvirska kukavica | | 4 |
| Orchis purpurea | škrlatnordeča kukavica | | 7 |
| Orchis signifera | zvezdnata kukavica | | 2 |
| Orchis sp. | kukavica | | 1 |
| Orchis tridentata | trizoba kukavica | | 25 |
| Orchis ustulata | pikastocvetna kukavica | | 15 |
| Orchis x dietrichiana Bogenh. (Orchis tridentata x Orchis ustulata) | | | 1 |
| Oreochromis niloticus | nilska tilapija, afriški nilski ostriž | | 1 |
| Orgyia antiqua | | | 1 |
| Origanum vulgare | navadna dobra misel | | 2 |
| Orlaya grandiflora | velecvetna vehrica | | 1 |
| Ornithogalum kochii | Kochovo ptičje mleko | | 4 |
| Ornithogalum sp. | ptičje mleko | | 3 |
| Ornithogalum sphaerocarpum agg. | skupina obloplodnega ptičjega mleka | | 4 |
| Ornithogalum umbellatum agg. | skupina kobulastega ptičjega mleka | | 2 |
| Orobanche caryophyllacea | navadni pojalnik | | 2 |
| Orobanche gracilis | nežni pojalnik | | 3 |
| Orobanche sp. | pojalnik | | 9 |
| Orthetrum albistylum | temni modrač | | 9 |
| Orthetrum brunneum | sinji modrač | | 9 |
| Orthetrum cancellatum | prodni modrač | | 12 |
| Orthetrum coerulescens | mali modrač | | 15 |
| Orthetrum sp. | modrač | | 12 |
| Orthoptera | Ravnokrilci | | 1 |
| Orthosia cerasi | | | 1 |
| Orthosia gothica | | | 1 |
| Orthosia incerta | | | 2 |
| Osmoderma eremita | puščavnik (eremit) | | 1 |
| Ostrya carpinifolia | črni gaber | | 10 |
| Otiorhynchus gemmatus | volkec | | 1 |
| Ourapteryx sambucaria | | | 1 |
| Oxalis acetosella | navadna zajčja deteljica | | 2 |
| Oxalis fontana | toga zajčja deteljica | | 1 |
| Oxalis sp. | zajčja deteljica | | 2 |
| Oxycarenus lavaterae | rjava lipovka | | 2 |
| Oxycoccus palustris | dlakava mahovnica | | 6 |
| Oxycoccus sp. | mahovnica | | 3 |
| Oxymirus cursor | | | 1 |
| Oxythyrea funesta | lisasta minica | | 1 |
| Pacifastacus leniusculus | signalni rak | | 20 |
| Padogobius bonelli | potočni glavoč | | 9 |
| Paederota bonarota | modro milje | | 2 |
| Paederota lutea | rumeno milje | | 2 |
| Paeonia officinalis | navadna potonika | | 15 |
| Paeonia sp. | potonika | | 2 |
| Paliurus spina-christi | navadni derak | | 5 |
| Pandion haliaetus | ribji orel | povodni skobec, morski orel, ljun | 1 |
| Panolis flammea | | | 1 |
| Panorpa germanica | nemška škorpijonka | | 1 |
| Papaver alpinum | | | 4 |
| Papaver alpinum ssp. rhaeticum | retijski mak | | 1 |
| Papaver rhoeas | poljski mak | | 22 |
| Papilio machaon | lastovičar | | 19 |
| Pararge aegeria | gozdni pegavček | | 11 |
| Pareulype berberata | | | 1 |
| Paris quadrifolia | volčja jagoda | | 14 |
| Parnassia palustris | močvirna samoperka | | 15 |
| Parnassius apollo | rdeči apolon | gorski apolon | 47 |
| Parnassius mnemosyne | črni apolon | | 20 |
| Parthenocissus quinquefolia | navadna vinika | | 2 |
| Parthenocissus tricuspidata | trokrpa vinika | | 1 |
| Parus caeruleus | plavček | | 7 |
| Parus major | velika sinica | jesenica, borštna senica | 3 |
| Paulownia tomentosa | pavlovnija | | 1 |
| Pechipogo strigilata | | | 1 |
| Pedicularis acaulis | brezstebelni ušivec | | 2 |
| Pedicularis rostratocapitata | glavičasti ušivec | | 1 |
| Pedicularis sp. | ušivec | | 2 |
| Pedicularis verticillata | vretenčasti ušivec | | 2 |
| Pelecus cultratus | sabljarka | | 1 |
| Pelobates fuscus | navadna česnovka | česnovka | 39 |
| Pelophylax lessonae | pisana žaba | | 3 |
| Pelophylax ridibundus | debeloglavka | | 10 |
| Pelophylax sp. | zelene žabe | | 209 |
| Peltaria alliacea | ploščevica | | 2 |
| Pentodon punctatus | | | 1 |
| Pentophera morio | travni prelček | | 3 |
| Perca fluviatilis | navadni ostriž | | 14 |
| Perconia strigillaria | | | 1 |
| Perdix perdix | jerebica | poljska jerebica, jerebica, jarebica, sivi jereb, poljski jereb | 2 |
| Peribatodes secundaria | | | 1 |
| Periplaneta americana | ameriški ščurek | | 3 |
| Perisomena caecigena | kraški pavlinček | | 2 |
| Perla marginata | | | 1 |
| Petasites albus | beli repuh | | 6 |
| Petasites hybridus | navadni repuh | | 10 |
| Petasites sp. | repuh | | 3 |
| Petrorhagia saxifraga | navadna haljica | | 1 |
| Peucedanum verticillare | orjaški silj | | 2 |
| Phalacrocorax carbo | kormoran | veliki kormoran, morski vran, veliki morski vran, veliki kavran, povodni vran, pmorski vran, črni pomorski vran | 24 |
| Phalacrocorax carbo sinensis | kormoran | | 2 |
| Phalaris arundinacea | pisana čužka | | 2 |
| Phalera bucephala | lunik | | 1 |
| Phasianus colchicus | fazan | navadni fazan, fazan, navadni tetrev | 5 |
| Phengaris alcon | sviščev mravljiščar | | 15 |
| Phengaris arion | veliki mravljiščar | | 4 |
| Phengaris nausithous | temni mravljiščar | | 9 |
| Phengaris sp. | | | 1 |
| Phengaris teleius | strašničin mravljiščar | | 32 |
| Pheosia tremula | | | 1 |
| Philaeus chrysops | | | 2 |
| Philereme transversata | | | 1 |
| Philomachus pugnax | togotnik | svadljivec, spremenljivi togotnik | 1 |
| Phleum hirsutum | dlakavi mačji rep | | 4 |
| Phleum paniculatum | latasti mačji rep | | 1 |
| Phleum sp. | mačji rep | | 1 |
| Phlogophora meticulosa | | | 1 |
| Phoenicurus ochruros | šmarnica | ilovščica, lipek, pogorelček, črnelka, črna taščica, švirglja, brojica, lipka | 3 |
| Pholcus phalangioides | dolgonogi hišni pajek | | 2 |
| Pholidoptera aptera | brezkrili skakalec | | 2 |
| Phoxinus lumaireul | | | 7 |
| Phoxinus phoxinus | pisanec | | 33 |
| Phragmites australis | navadni trst | | 21 |
| Phthirius pubis | sramna uš, kršelj | | 1 |
| Phyllitis scolopendrium | jelenov jezik | | 10 |
| Phyllodesma tremulifolia | | | 1 |
| Physalis alkekengi | navadno volčje jabolko | | 7 |
| Physocarpus opulifolius | kalinolistni pokalec | | 8 |
| Phyteuma orbiculare | glavičasti repuš | | 4 |
| Phyteuma ovatum | jajčasti repuš | | 7 |
| Phyteuma scheuchzeri | scheuchzerjev repuš | | 1 |
| Phyteuma sieberi | sieberjev repuš | | 1 |
| Phyteuma spicatum ssp. coeruleum | | | 1 |
| Phyteuma spicatum ssp. spicatum | klasasti repuš | | 2 |
| Phytolacca americana | navadna barvilnica | | 7 |
| Picea abies | navadna smreka | | 14 |
| Picidae | Žolne | | 1 |
| Pieris brassicae | kapusov belin | | 4 |
| Pieris bryoniae | planinski belin | | 10 |
| Pieris ergane | mali belin | | 7 |
| Pieris mannii | primorski belin | | 2 |
| Pieris napi | repičin belin | | 15 |
| Pieris rapae | repin belin | | 6 |
| Pieris sp. | | | 1 |
| Pinguicula alpina | alpska mastnica | | 6 |
| Pinguicula sp. | mastnica | | 2 |
| Pinguicula vulgaris | navadna mastnica | | 7 |
| Pinus mugo | rušje | | 19 |
| Pinus nigra | črni bor | | 10 |
| Pinus pinea | pinija | | 3 |
| Pinus sp. | bor | | 2 |
| Pinus strobus | gladki bor (zeleni bor) | | 6 |
| Pinus sylvestris | rdeči bor | | 17 |
| Pipistrellus kuhlii | belorobi netopir | | 17 |
| Pipistrellus nathusii | Nathusijev netopir | | 10 |
| Pipistrellus pipistrellus | mali netopir | | 18 |
| Pipistrellus pygmaeus | drobni netopir | | 17 |
| Pipistrellus sp. | | | 4 |
| Pisaura mirabilis | Scopolijev lepi volkec | | 6 |
| Pisauridae | | | 1 |
| Pisces | Ribe | | 4 |
| Pistia stratiotes | vodna solata | | 46 |
| Pisum sativum | navadni grah | | 2 |
| Placobdella costata | | | 4 |
| Plagodis pulveraria | | | 1 |
| Plantae | Rastline | | 13 |
| Plantago lanceolata | ozkolistni trpotec | | 3 |
| Plantago media | srednji trpotec | | 6 |
| Plantago sp. | trpotec | | 2 |
| Platanthera bifolia | dvolistni vimenjak | | 7 |
| Platanthera chlorantha | zelenkasti vimenjak | | 4 |
| Platanus x hispanica | javorolistna platana | | 2 |
| Platybunus bucephalus | Navádni širokoókec | | 1 |
| Platycnemis pennipes | sinji presličar | | 6 |
| Plebejus argus | širokorobi mnogook | | 9 |
| Plebejus argyrognomon | srebrni mnogook | | 1 |
| Plebejus idas | ozkorobi mnogook | | 10 |
| Plebejus sp. | | | 1 |
| Plecoptera | Vrbnice | | 17 |
| Plecotus auritus | rjavi uhati netopir | | 25 |
| Plecotus austriacus | sivi uhati netopir | | 11 |
| Plecotus macrobullaris | usnjebradi uhati netopir | | 32 |
| Plecotus sp. | | | 15 |
| Plemyria rubiginata | | | 1 |
| Poaceae | Trave | | 9 |
| Poa trivialis | navadna latovka | | 1 |
| Podarcis melisellensis | kraška kuščarica, obrežna kuščarica | | 1 |
| Podarcis muralis | pozidna kuščarica | | 97 |
| Podarcis muralis/Iberolacerta horvathi | | | 1 |
| Podarcis siculus | primorska kuščarica | | 2 |
| Podiceps cristatus | čopasti ponirek | | 3 |
| Poecilocampa populi | | | 1 |
| Polia nebulosa | | | 3 |
| Polygala amara | grenka grebenuša | | 3 |
| Polygala chamaebuxus | žanjevec | | 3 |
| Polygala comosa | čopasta grebenuša | | 1 |
| Polygala nicaeensis | francoska grebenuša | | 1 |
| Polygala sp. | grebenuša | | 5 |
| Polygonatum multiflorum | mnogocvetni salomonov pečat | | 1 |
| Polygonatum odoratum | dišeči salomonov pečat | | 4 |
| Polygonatum sp. | salomonov pečat | | 8 |
| Polygonatum verticillatum | vretenčasti salomonov pečat | | 1 |
| Polygonia c-album | beli c | | 7 |
| Polygonia egea | beli l | | 3 |
| Polygonum amphibium | vodna dresen | | 3 |
| Polygonum aviculare ssp. aviculare | | | 1 |
| Polygonum bistorta | kačja dresen | | 2 |
| Polygonum lapathifolium | ščavjelistna dresen | | 1 |
| Polygonum mite | mila dresen | | 3 |
| Polygonum persicaria | breskova dresen | | 1 |
| Polygonum viviparum | živorodna dresen | | 1 |
| Polyommatus amandus | ljubki modrin | | 6 |
| Polyommatus bellargus | sinji modrin | lepi argus | 17 |
| Polyommatus coridon | kraški modrin | kraški argus | 13 |
| Polyommatus daphnis | nazobčani modrin | nazobčani argus | 8 |
| Polyommatus dorylas | turkizni modrin | | 6 |
| Polyommatus escheri | primorski modrin | | 3 |
| Polyommatus icarus | navadni modrin | | 23 |
| Polyommatus semiargus | modri grašičar | | 5 |
| Polyommatus thersites | deteljin modrin | | 7 |
| Polypodium sp. | sladka koreninica | | 3 |
| Polypodium vulgare | navadna sladka koreninica | | 4 |
| Polytrichum sp. | | | 1 |
| Pontia daplidice | katančev selec | | 4 |
| Populus alba | beli topol | | 5 |
| Populus sp. | topol | | 11 |
| Populus tremula | trepetlika | | 2 |
| Potamogeton berchtoldii | berchtoldov dristavec | | 1 |
| Potamogeton crispus | kodravi dristavec | | 2 |
| Potamogeton lucens | bleščeči dristavec | | 3 |
| Potamogeton natans | plavajoči dristavec | | 7 |
| Potamogeton pectinatus | češljasti dristavec | | 2 |
| Potamogeton perfoliatus | preraslolistni dristavec | | 4 |
| Potamogeton sp. | dristavec | | 13 |
| Potamogeton x zizii (P. lucens x gramineus) | | | 1 |
| Potentilla anserina | gosji petoprstnik | | 1 |
| Potentilla carniolica | kranjski petoprstnik | | 2 |
| Potentilla caulescens | predalpski petoprstnik | | 2 |
| Potentilla clusiana | clusijev petoprstnik | | 1 |
| Potentilla erecta | srčna moč | | 1 |
| Potentilla heptaphylla | sedmerolistni petoprstnik | | 1 |
| Potentilla micrantha agg. | skupina drobnocvetnega petoprstnika | | 1 |
| Potentilla nitida | triglavska roža | | 2 |
| Potentilla rupestris | skalni petoprstnik | | 1 |
| Potentilla sp. | petoprstnik | | 2 |
| Potentilla supina | polegli petoprstnik | | 1 |
| Primula auricula | avrikelj | | 16 |
| Primula elatior | visoki jeglič | | 3 |
| Primula halleri | dolgocvetni jeglič | | 2 |
| Primula minima | najmanjši jeglič | | 2 |
| Primula sp. | jeglič | | 2 |
| Primula veris | pomladanski jeglič | | 1 |
| Primula vulgaris | trobentica | | 9 |
| Primula wulfeniana | Wulfenov jeglič | | 5 |
| Prionotropis hystrix | žagasta kamenka | | 1 |
| Prionus coriarius | strojar (usnjar) | | 6 |
| Procerus gigas | orjaški krešič | povžarca | 4 |
| Prokelisia marginata | japonski škržatek | | 1 |
| Protodeltote pygarga | | | 1 |
| Prunella grandiflora | velecvetna črnoglavka | | 2 |
| Prunella laciniata | deljenolistna črnoglavka | | 2 |
| Prunella vulgaris | navadna črnoglavka | | 1 |
| Prunus avium | češnja | | 10 |
| Prunus mahaleb | rešeljika | | 3 |
| Prunus padus | čremsa | | 16 |
| Prunus persica | breskev | | 4 |
| Prunus spinosa | črni trn | | 20 |
| Prunus spinosa | črni trn | | 7 |
| Prunus spinosa agg. | skupina črnega trna | | 3 |
| Pseudemys concinna | | | 2 |
| Pseudepidalea viridis | zelena krastača | | 18 |
| Pseudoips prasinana | | | 2 |
| Pseudolysimachion barrelieri | Barrelierov pajetičnik | | 3 |
| Pseudopanthera macularia | | | 3 |
| Pseudophilotes vicrama | šetrajev sleparček | | 7 |
| Pseudorasbora parva | psevdorasbora | amurski čebačok | 9 |
| Pseudostellaria europaea | evropska gomoljčica | | 3 |
| Psorodonotus illyricus | | | 2 |
| Psychidae | Vrečkarji | | 1 |
| Psychodidae | Metuljaste mušice | | 1 |
| Pterapherapteryx sexalata | | | 1 |
| Pteridium aquilinum | orlova praprot | | 9 |
| Pteronemobius heydenii | močvirski muren | | 2 |
| Pterophorus pentadactylus | beli peresičar | | 1 |
| Pterostoma palpina | | | 1 |
| Ptilodon capucina | | | 3 |
| Pulex irritans | človeška bolha | | 1 |
| Pulmonaria dacica | dacijski pljučnik | | 3 |
| Pulmonaria mollissima | mehkodlakavi pljučnik | | 6 |
| Pulmonaria officinalis | navadni pljučnik | | 7 |
| Pulmonaria sp. | pljučnik | | 2 |
| Pulmonata | Pljučarji | | 2 |
| Pulsatilla alba | beli kosmatinec | | 2 |
| Pulsatilla alpina agg. | skupina alpskega kosmatinca | | 3 |
| Pulsatilla grandis | velikonočnica | | 4 |
| Pulsatilla montana | gorski kosmatinec | | 38 |
| Pulsatilla nigricans | navadni kosmatinec | | 7 |
| Puncha ratzeburgi | Ratzeburgerjeva kamelovratnica | | 1 |
| Pyrausta nigrata | | | 1 |
| Pyrausta sp. | | | 1 |
| Pyrgus alveus | zelenosivi slezovček | | 3 |
| Pyrgus andromedae | planinski slezovček | | 3 |
| Pyrgus armoricanus | jagodnjakov slezovček | | 5 |
| Pyrgus carthami | veliki slezovček | | 2 |
| Pyrgus malvae | navadni slezovček | | 9 |
| Pyrgus malvae/malvoides | | | 2 |
| Pyrgus sp. | slezovčki | | 3 |
| Pyrgus warrenensis | warrenov slezovček | Warrenov slezovček | 1 |
| Pyrochroa sp. | | | 2 |
| Pyrola sp. | zelenka | | 1 |
| Pyronia tithonus | gozdni vratar | temna ognjenka | 7 |
| Pyrrhocorax graculus | planinska kavka | planinska vrana, kramparica, planinski kos, planinski škorec, planinska sojka, klavžar, sojka | 3 |
| Pyrrhocoris apterus | šuštar (rdeči škratec) | | 1 |
| Pyrrhosoma nymphula | rani plamenec | | 18 |
| Pyrus communis | hruška | | 1 |
| Pyrus pyraster | drobnica | | 2 |
| Quercus cerris | cer | | 6 |
| Quercus ilex | črničevje | | 2 |
| Quercus petraea | graden | | 4 |
| Quercus pubescens | puhasti hrast | | 2 |
| Quercus robur | dob | | 15 |
| Quercus rubra | rdeči hrast | | 2 |
| Quercus sp. | hrast | | 4 |
| Rallus aquaticus | mokož | capovoznik, mlakar, mlakni capovoznik, srednji mlakož | 3 |
| Rana arvalis | plavček | barska žaba | 402 |
| Rana arvalis/temporaria | | | 40 |
| Rana dalmatina | rosnica | | 499 |
| Rana esculenta complex | skupina zelenih žab | | 1 |
| Rana kl. esculenta | zelena žaba | | 1 |
| Rana latastei | laška žaba | | 320 |
| Rana latastei/dalmatina | | | 18 |
| Rana (Pelophylax) sp. | zelene žabe | | 35 |
| Rana (Rana) sp. | rjave žabe | | 12 |
| Rana ridibunda | debeloglavka | | 9 |
| Rana sp. | prave žabe | | 219 |
| Rana temporaria | sekulja | | 418 |
| Ranatra linearis | paličasti ščipalec (vodna igla) | | 2 |
| Ranunculus aquatilis agg. | skupina navadne vodne zlatice | | 6 |
| Ranunculus arvensis | njivska zlatica | | 2 |
| Ranunculus bulbosus | gomoljasta zlatica | | 5 |
| Ranunculus ficaria | lopatičasta zlatica | | 5 |
| Ranunculus ficaria ssp. bulbilifer | | | 6 |
| Ranunculus fluitans | plavajoča vodna zlatica | | 1 |
| Ranunculus hybridus | izrodna zlatica | | 2 |
| Ranunculus lanuginosus | kosmata zlatica | | 1 |
| Ranunculus lingua | velika zlatica | | 3 |
| Ranunculus nemorosus | gozdna zlatica | | 2 |
| Ranunculus peltatus ssp. baudotii | | | 6 |
| Ranunculus sardous | srhkodlakava zlatica | | 1 |
| Ranunculus sceleratus | opih | | 1 |
| Ranunculus scutatus | ščitasta zlatica | | 1 |
| Ranunculus sp. | zlatica | | 8 |
| Ranunculus thora | opojna zlatica | | 2 |
| Ranunculus traunfellneri | traunfellnerjeva zlatica | | 2 |
| Raphidiidae | Prave kamelovratnice | | 2 |
| Rattus norvegicus | siva podgana | | 2 |
| Reseda lutea | rumeni katanec | | 5 |
| Reynoutria japonica | japonski dresnik | | 14 |
| Rhagium mordax | zalubni kozliček | | 2 |
| Rhamnus catharticus | čistilna kozja češnja | | 3 |
| Rhamnus fallax | kranjska kozja češnja | | 1 |
| Rhamnus pumila | nizka kozja češnja | | 1 |
| Rhamnus saxatilis | razkrečena kozja češnja | | 1 |
| Rhinanthus minor | mali škrobotec | | 1 |
| Rhinanthus sp. | škrobotec | | 2 |
| Rhinolophus euryale | južni podkovnjak | | 13 |
| Rhinolophus ferrumequinum | veliki podkovnjak | | 141 |
| Rhinolophus hipposideros | mali podkovnjak | | 342 |
| Rhodeus amarus | pezdirk | | 12 |
| Rhododendron hirsutum | dlakavi sleč | | 5 |
| Rhododendron luteum | rumeni sleč | | 5 |
| Rhododendron sp. | sleč | | 4 |
| Rhodometra sacraria | | | 1 |
| Rhodothamnus chamaecistus | navadni slečnik | | 5 |
| Rhus typhina | octovec | | 1 |
| Rhynchospora alba | bela kljunka | | 2 |
| Rhyparia purpurata | | | 3 |
| Rhysodes sulcatus | brazdar | | 1 |
| Ribes uva-crispa | kosmulja | | 1 |
| Riparia riparia | breguljka | podgrivka, breguljica, obrežna lastovica, bregja lastovica, povodna lastovka, potoha | 1 |
| Rivula sericealis | | | 1 |
| Robinia pseudacacia | robinija | | 31 |
| Rodentia | Glodalci | | 1 |
| Romanogobio benacensis | primorski globoček | italijanski globoček | 3 |
| Romanogobio kesslerii | Kesslerjev globoček | | 7 |
| Romanogobio uranoscopus | zvezdogled | | 6 |
| Romanogobio vladykovi | beloplavuti globoček | | 34 |
| Rorippa amphibia | prava potočarka | | 2 |
| Rorippa sylvestris | divja potočarka | | 2 |
| Rosa arvensis | njivni šipek | | 2 |
| Rosa canina | navadni šipek | | 1 |
| Rosa gallica | francoski šipek | | 1 |
| Rosalia alpina | alpski kozliček | planinski kozliček | 5 |
| Rosa pendulina | kimastoplodni šipek | | 2 |
| Rosa sp. | šipek | | 10 |
| Rubus caesius | sinjezelena robida | | 1 |
| Rubus idaeus | malinjak | | 1 |
| Rubus saxatilis | skalna robida | | 1 |
| Rubus sp. | robida | | 6 |
| Rudbeckia hirta | srhkodlakava rudbekija | | 2 |
| Rudbeckia laciniata | deljenolistna rudbekija | | 9 |
| Rudbeckia sp. | rudbekija | | 1 |
| Rumex acetosella | mala kislica | | 2 |
| Rumex acetosella | mala kislica | | 1 |
| Rumex hydrolapathum | konjska kislica | | 3 |
| Rumex sp. | kislica | | 1 |
| Rupicapra rupicapra | gams | | 4 |
| Ruscus aculeatus | bodeča lobodika | | 10 |
| Ruscus hypoglossum | širokolistna lobodika | | 7 |
| Ruta divaricata | razkrečena rutica | | 3 |
| Ruta graveolens | vinska rutica | | 2 |
| Rutilus aula | mazenica | | 4 |
| Rutilus rutilus | rdečeoka | črnovka | 4 |
| Rutilus sp. | rdečeoke | | 1 |
| Rutilus virgo | platnica | | 4 |
| Sabanejewia balcanica | zlata nežica | | 11 |
| Saga pedo | žagarica | | 2 |
| Sagittaria sagittifolia | navadna streluša | | 7 |
| Sagittaria sp. | streluša | | 2 |
| Salamandra atra | planinski močerad | | 31 |
| Salamandra salamandra | navadni močerad | | 138 |
| Salix alba | bela vrba | | 11 |
| Salix alba agg. | skupina bele vrbe | | 2 |
| Salix caprea | iva | | 4 |
| Salix eleagnos | siva vrba | | 1 |
| Salix retusa | topolistna vrba | | 1 |
| Salix sp. | vrba | | 25 |
| Salmo marmoratus | soška postrv | | 17 |
| Salmo sp. | postrvi | | 11 |
| Salmo trutta | postrv | | 79 |
| Salmo trutta x Salmo marmoratus | križanec (potočna x soška postrv) | | 9 |
| Saltatoria | kobilice | | 8 |
| Salvia glutinosa | lepljiva kadulja | | 1 |
| Salvia officinalis | žajbelj | | 9 |
| Salvia pratensis | travniška kadulja | | 8 |
| Salvia verticillata | vretenčasta kadulja | | 2 |
| Salvinia natans | plavajoči plavček | | 9 |
| Sambucus ebulus | smrdljivi bezeg | | 8 |
| Sambucus nigra | črni bezeg | | 9 |
| Sambucus racemosa | divji bezeg | | 2 |
| Sander lucioperca | smuč | | 1 |
| Sanguisorba minor | mala strašnica, zelena svitlica | | 1 |
| Sanguisorba minor | mala strašnica | | 2 |
| Sanguisorba minor agg. | skupina male strašnice | | 1 |
| Sanguisorba officinalis | zdravilna strašnica | | 46 |
| Sanicula europaea | navadni ženikelj | | 2 |
| Saponaria officinalis | navadna milnica | | 2 |
| Satureja montana | | | 1 |
| Satureja subspicata | pritlikavi šetraj | | 1 |
| Satureja subspicata ssp. liburnica | liburnijski šetraj | | 2 |
| Saturnia pavonia | mali nočni pavlinček (mali pavlinec) | | 1 |
| Saturnia pavoniella | | | 5 |
| Saturnia pyri | veliki nočni pavlinček (veliki pavlinec) | | 2 |
| Satyrium acaciae | mali repkar | | 7 |
| Satyrium ilicis | hrastov repkar | | 8 |
| Satyrium pruni | slivov repkar | | 8 |
| Satyrium spini | trnov repkar | | 11 |
| Satyrium w-album | beločrti repkar | | 5 |
| Satyrus ferula | skalni okar | | 11 |
| Saxicola torquata | prosnik | črnoglavi prosnik, črnovratni prusnik, bela penica, beli muharček | 1 |
| Saxifraga aizoides | vednozeleni kamnokreč | | 2 |
| Saxifraga bulbifera | brstični kamnokreč | | 5 |
| Saxifraga crustata | skorjasti kamnokreč | | 4 |
| Saxifraga cuneifolia | klinolistni kamnokreč | | 1 |
| Saxifraga paradoxa | nenavadni kamnokreč | | 2 |
| Saxifraga petraea | skalni kamnokreč | | 1 |
| Saxifraga rotundifolia | okroglolistni kamnokreč | | 1 |
| Saxifraga sedoides | homulični kamnokreč | | 1 |
| Saxifraga stellaris | zvezdasti kamnokreč | | 3 |
| Saxifraga tridactylites | triprsti kamnokreč | | 1 |
| Scabiosa columbaria | navadni grintavec | | 1 |
| Scabiosa hladnikiana | hladnikov grintavec | | 2 |
| Scabiosa sp. | grintavec | | 1 |
| Scabiosa triandra | poljski grintavec | | 1 |
| Scarabaeidae | Skarabeji | | 2 |
| Scardinius erythrophthalmus | rdečeperka | | 7 |
| Sceliphron caementarium | ameriška grebača zidarka | | 1 |
| Sceliphron curvatum | azijska grebača zidarka | | 1 |
| Scheuchzeria palustris | močvirska grezulja | | 3 |
| Schiziphthirius sp. | | | 1 |
| Schoenoplectus lacustris | jezerski biček | | 8 |
| Schoenoplectus lacustris agg. | skupina jezerskega bička | | 1 |
| Schoenoplectus mucronatus | ostnati biček | | 2 |
| Schoenoplectus tabernaemontani | sinjezeleni biček | | 2 |
| Schoenus nigricans | črnikasti sitovec | | 7 |
| Scilla bifolia | dvolistna morska čebulica | | 7 |
| Scilla bifolia | | | 2 |
| Scilla litardierei | travniška morska čebulica | | 3 |
| Scilla sp. | morska čebulica | | 1 |
| Scirpus sp. | sitec | | 3 |
| Scirpus sylvaticus | gozdni sitec | | 1 |
| Sciurus vulgaris | veverica | | 3 |
| Scoliopteryx libatrix | | | 2 |
| Scolitantides orion | homuljičin krivček | | 8 |
| Scolytidae | Zalubniki (Podlubniki, Lubadarji) | | 1 |
| Scoparia sp. | | | 1 |
| Scopolia carniolica | kranjska bunika | | 9 |
| Scopolia carniolica f. hladnikiana | hladnikova bunika, hladnikov volčič | | 3 |
| Scopula floslactata | | | 1 |
| Scopula immutata | | | 1 |
| Scopula marginepunctata | | | 1 |
| Scopula nigropunctata | | | 1 |
| Scopula ternata | | | 2 |
| Scorpiones | Ščipalci (Škorpijoni) | | 7 |
| Scorzonera austriaca | avstrijski gadnjak | | 1 |
| Scorzonera rosea | rožnati gadnjak | | 2 |
| Scrophularia canina | pasja črnobina | | 1 |
| Scrophularia nodosa | navadna črnobina | | 1 |
| Scrophularia vernalis | spomladanska črnobina | | 2 |
| Scutellaria hastifolia | kopjastolistna čeladnica | | 2 |
| Sedum acre | ostra homulica | | 2 |
| Sedum album | bela homulica | | 6 |
| Sedum maximum | hermelika | | 2 |
| Sedum sexangulare | šesterokotna homulica | | 3 |
| Sedum sp. | homulica | | 3 |
| Selenia dentaria | | | 1 |
| Selenia tetralunaria | | | 2 |
| Selysiothemis nigra | temni slaniščar | | 1 |
| Sempervivum tectorum | navadni netresk | | 5 |
| Senecio aquaticus | vodni grint | | 5 |
| Senecio fuchsii | fuchsov grint | | 1 |
| Senecio ovirensis | obirski grint | | 1 |
| Serapias vomeracea | velecvetni serap | | 1 |
| Serpentes | kače | | 2 |
| Sesleria juncifolia | (skupina) tankolistna vilovina | | 4 |
| Sesleria varia | (skupina) pisana vilovina | | 1 |
| Sialis sp. | blatnice | | 2 |
| Silene acaulis | brezstebelna lepnica | | 1 |
| Silene baccifera | navadni rokavec | | 2 |
| Silene dioica | rdeči slizek | | 1 |
| Silene latifolia ssp. alba | beli slizek | | 1 |
| Silene nutans | kimasta lepnica | | 1 |
| Silene vulgaris | pokalica | | 1 |
| Silurus glanis | som | pravi som | 5 |
| Sinodendron cylindricum | valjasti nosorožec | | 1 |
| Siona lineata | črtasti pedic | | 1 |
| Siphlonurus croaticus | | | 1 |
| Sitta europaea | brglez | sivi brglez, gozdni brglez | 2 |
| Smerinthus ocellata | večerni pavlinček | | 1 |
| Smyrnium perfoliatum | prerasla repušica | | 1 |
| Solanum dulcamara | grenkoslad | | 4 |
| Solanum lycopersicum | paradižnik | | 1 |
| Solanum nigrum | pasje zelišče | | 2 |
| Solanum tuberosum | krompir | | 3 |
| Soldanella alpina | navadni alpski zvonček | | 1 |
| Soldanella minima | najmanjši alpski zvonček | | 1 |
| Solidago canadensis | kanadska zlata rozga | | 7 |
| Solidago gigantea | orjaška zlata rozga | | 6 |
| Solidago sp. | zlata rozga | | 5 |
| Solidago virgaurea | navadna zlata rozga | | 2 |
| Somatochlora arctica | barjanski lesketnik | | 1 |
| Somatochlora flavomaculata | pegasti lesketnik | lisasti lesketnik | 2 |
| Somatochlora meridionalis | sredozemski lesketnik | | 6 |
| Sorbus aria | navadni mokovec | | 7 |
| Sorbus aria | navadni mokovec | | 1 |
| Sorbus aucuparia | jerebika | | 11 |
| Sorbus domestica | skorš | | 6 |
| Sorbus torminalis | brek | | 8 |
| Sorex sp. | | | 3 |
| Sorghum saccharatum | navadni sirek | | 2 |
| Soricidae | | | 6 |
| Sparganium emersum | enostavni ježek | | 3 |
| Sparganium erectum agg. | skupina pokončnega ježka | | 3 |
| Sparganium sp. | ježek | | 8 |
| Spartium junceum | navadna žuka | | 6 |
| Sphagnum sp. | | | 19 |
| Sphinx pinastri | | | 1 |
| Spialia sertorius | rdečkasti venčar | | 3 |
| Spilosoma lubricipeda | beli kosmatinec | | 1 |
| Spilosoma lutea | | | 3 |
| Spiraea japonica | japonska medvejka | | 4 |
| Spiraea sp. | medvejka | | 4 |
| Spiranthes spiralis | zavita škrbica | | 3 |
| Spirodela polyrhiza | navadna žabja leča | | 2 |
| Squalius cephalus | klen | | 31 |
| Squalius squalus | štrkavec | | 8 |
| Stachys palustris | močvirnati čišljak | | 1 |
| Stachys recta | pokončni čišljak | | 2 |
| Stalita sp. | | | 3 |
| Stalita taenaria | podzemeljski šesterookec | | 1 |
| Staphylea pinnata | navadni kloček | | 4 |
| Stauropus fagi | bukov prelec | | 2 |
| Stellaria holostea | velecvetna zvezdica | dremulica | 4 |
| Stemmacantha rhapontica | rapontika | | 4 |
| Stenobothrus rubicundus | | | 1 |
| Stipa eriocaulis | peresasta bodalica | | 13 |
| Strangalia maculata | pegasti vitki kozliček | | 1 |
| Strangalia melanura | | | 1 |
| Stratiotes aloides | vodna škarjica | | 17 |
| Streptopelia decaocto | turška grlica | laška grlica, mestna grlica, velika grlica, gugutka, smejačica | 1 |
| Strix aluco | lesna sova | navadna sova, rjava sova, rumena sova, siva sova, skalna sova, veliki gozdni čuk, vubuj | 11 |
| Sturnus vulgaris | škorec | navadni škorec, pisani škorec, storlin | 1 |
| Succisa pratensis | travniška izjevka | | 1 |
| Sus scropha | divji prašič, divja svinja | | 5 |
| Sympecma fusca | prisojni zimnik | | 5 |
| Sympetrum depressiusculum | stasiti kamenjak | | 2 |
| Sympetrum fonscolombii | malinovordeči kamenjak | | 2 |
| Sympetrum pedemontanum | pasasti kamenjak | | 1 |
| Sympetrum sanguineum | krvavordeči kamenjak | | 16 |
| Sympetrum sp. | kamenjak | | 3 |
| Sympetrum striolatum | progasti kamenjak | | 1 |
| Sympetrum vulgatum | navadni kamenjak | | 10 |
| Symphytum officinale | navadni gabez | | 3 |
| Symphytum officinale | navadni gabez | | 1 |
| Symphytum tuberosum | gomoljasti gabez | | 5 |
| Syngrapha interrogationis | | | 2 |
| Talpa europaea | navadni krt | | 6 |
| Tamus communis | navadni bljušč | | 4 |
| Tanacetum corymbosum | češuljasti vratič | | 5 |
| Tanacetum vulgare | navadni vratič | | 3 |
| Taraxacum officinale | navadni regrat | | 7 |
| Taraxacum sp. | regrat | | 2 |
| Taxus baccata | tisa | | 2 |
| Tegenaria ferruginea | | | 5 |
| Telekia speciosa | navadna ognjica | | 6 |
| Telestes souffia | blistavec | | 13 |
| Tephrina arenacearia | | | 1 |
| Tephroseris aurantiaca | oranžna sivica | | 3 |
| Tephroseris integrifolia | travniška sivica | | 2 |
| Testudo hermanni | grška kornjača | | 5 |
| Tetrao urogallus | divji petelin | veliki divji petelin, petelin, velika kura, lesni petelin, horopka | 3 |
| Teucrium chamaedrys | navadni vrednik | | 1 |
| Teucrium montanum | gorski vrednik | | 2 |
| Teucrium scorodonia | žajbljasti vrednik | | 1 |
| Thalictrum aquilegiifolium | vetrovka | | 2 |
| Thaumetopoea sp. | | | 1 |
| Thecla betulae | lepi brezar | | 18 |
| Thera variata | | | 1 |
| Thesium alpinum | alpska lanika | | 1 |
| Thesium linophyllon | navadna lanika | | 1 |
| Thlaspi praecox | rani mošnjak | | 2 |
| Tholera decimalis | | | 2 |
| Thomisidae | Rakovičarji (Rakovičasti pajki) | | 1 |
| Thyatira batis | rožnata volnohrbtka | | 1 |
| Thymallus thymallus | lipan | | 8 |
| Thymelicus acteon | lunolisi debeloglavček | | 1 |
| Thymelicus lineola | kratkočrti debeloglavček | | 7 |
| Thymelicus sp. | | | 1 |
| Thymelicus sylvestris | dolgočrti debeloglavček | | 6 |
| Thymus sp. | materina dušica | | 2 |
| Thyris fenestrella | okenčkar | | 1 |
| Tilia cordata | lipovec | | 1 |
| Tilia platyphyllos | lipa | | 8 |
| Tilia sp. | lipa | | 2 |
| Timandra sp. | | | 1 |
| Tinca tinca | linj | | 15 |
| Titanethes sp. | jamske mokrice | | 3 |
| Tofieldia calyculata | navadna žiljka | | 5 |
| Trachea atriplicis | | | 2 |
| Trachemys scripta | | | 15 |
| Trachemys scripta elegans | rdečevratka | | 81 |
| Trachemys scripta scripta | rumenovratka | | 2 |
| Tracheophyta | | | 1 |
| Tragopogon pratensis | | | 1 |
| Tragopogon pratensis ssp. orientalis | vzhodna kozja brada | | 4 |
| Tragopogon sp. | kozja brada | | 3 |
| Trapa natans | vodni orešek | | 11 |
| Traunsteinera globosa | navadna oblasta kukavica | | 5 |
| Trichius fasciatus | | | 1 |
| Trichodes favarius | | | 1 |
| Trichoptera | Mladoletnice | | 9 |
| Trichopteryx carpinata | | | 1 |
| Trifolium incarnatum | inkarnatka | | 3 |
| Trifolium medium | srednja detelja | | 1 |
| Trifolium montanum | gorska detelja | | 8 |
| Trifolium ochroleucon | rumenkastobela detelja | | 1 |
| Trifolium pannonicum | panonska detelja | | 3 |
| Trifolium repens | plazeča detelja | | 1 |
| Trifolium rubens | škrlatnordeča detelja | | 2 |
| Tringa glareola | močvirski martinec | | 2 |
| Tringa sp. | martinci | | 2 |
| Triphosa dubitata | | | 7 |
| Triphosa sabaudiata | | | 1 |
| Trisetum flavescens | rumenkasti ovsenec | | 1 |
| Triticum sp. | pšenica | | 1 |
| Triturus alpestris | planinski pupek | | 60 |
| Triturus carnifex | veliki pupek | | 231 |
| Triturus sp. | pupki | | 4 |
| Triturus vulgaris | navadni pupek | mali pupek | 13 |
| Triturus vulgaris meridionalis | robati pupek | | 3 |
| Triturus vulgaris vulgaris | mali pupek | | 2 |
| Trochosa sp. | | | 1 |
| Troglodytes troglodytes | stržek | palček, strešik, kraljiček, strež, rjavi stržek, strješek, pavčeč | 1 |
| Troglophilus cavicola | | | 1 |
| Troglophilus sp. | | | 6 |
| Trollius europaeus | navadna pogačica | | 12 |
| Tropinota hirta | kosmata minica | kosmati cvetožer | 2 |
| Tubifex sp. | | | 2 |
| Turdus philomelos | cikovt | drozg, cikavt, navadni drozg | 2 |
| Turdus pilaris | brinovka | brinjevka, smolnica, branjug, borovnjak, brinovi drozg, velika brinovka | 4 |
| Tussilago farfara | navadni lapuh | | 8 |
| Typha angustifolia | ozkolistni rogoz | | 3 |
| Typha latifolia | širokolistni rogoz | | 35 |
| Typha minima | najmanjši rogoz | | 1 |
| Typha sp. | rogoz | | 5 |
| Tyria jacobaeae | | | 5 |
| Ulmus sp. | brest | | 4 |
| Umbra krameri | velika senčica | | 15 |
| Unio crassus | potočni škržek (navadni škržek) | | 44 |
| Unionidae | | | 8 |
| Unio pictorum | slikarski škržek | | 3 |
| Unio sp. | škržek | | 5 |
| Ursus arctos | medved (rjavi medved) | | 6 |
| Urtica dioica | velika kopriva | | 7 |
| Utricularia sp. | mešinka | | 3 |
| Utricularia vulgaris agg. | skupina navadne mešinke | | 1 |
| Vaccinium myrtillus | borovnica | | 4 |
| Vaccinium vitis-idaea | brusnica | | 3 |
| Valeriana dioica | dvodomna špajka | | 2 |
| Valeriana officinalis | zdravilna špajka | | 2 |
| Valeriana sp. | špajka | | 2 |
| Valeriana tripteris | tripernata špajka | | 1 |
| Valerianella locusta | navadni motovilec | | 1 |
| Valerianella sp. | motovilec | | 2 |
| Vanellus vanellus | priba | vivek, gavek, gavec, čibes, pegulica, pipulica | 7 |
| Vanessa atalanta | admiral | | 5 |
| Vanessa cardui | osatnik | | 13 |
| Veratrum album | bela čmerika | | 5 |
| Veratrum album ssp. album | | | 7 |
| Veratrum album ssp. lobelianum | | | 2 |
| Veratrum nigrum | črna čmerika | | 4 |
| Verbascum blattaria | grozdasti lučnik | | 5 |
| Verbascum densiflorum | velecvetni lučnik | | 1 |
| Verbascum phoeniceum | vijolični lučnik | | 4 |
| Verbascum sp. | lučnik | | 3 |
| Verbena officinalis | navadni sporiš | | 1 |
| Veronica aphylla | brezlistni jetičnik | | 2 |
| Veronica beccabunga | studenčni jetičnik | | 3 |
| Veronica jacquinii | Jacquinov jetičnik | | 4 |
| Veronica officinalis | zdravilni jetičnik | | 4 |
| Veronica persica | perzijski jetičnik | | 4 |
| Veronica serpyllifolia | timijanov jetičnik | | 2 |
| Vespa crabro | sršen | | 8 |
| Vespertilio murinus | dvobarvni netopir | | 9 |
| Vespidae | Prave ose (Družbene ose) | | 4 |
| Viburnum lantana | dobrovita | | 7 |
| Viburnum opulus | brogovita | | 8 |
| Vicia angustifolia | ozkolistna grašica | | 2 |
| Vicia grandiflora | velecvetna grašica | | 4 |
| Vicia oroboides | širokolistna grašica | | 1 |
| Vicia sativa | navadna grašica | | 1 |
| Vimba vimba | ogrica | | 1 |
| Vinca major | veliki zimzelen | | 2 |
| Vinca minor | navadni zimzelen | | 9 |
| Vincetoxicum hirundinaria | navadni kokoševec | | 7 |
| Viola alba | bela vijolica | | 1 |
| Viola arvensis | njivska vijolica | | 3 |
| Viola biflora | dvocvetna vijolica | | 3 |
| Viola mirabilis | navadna vijolica | neobičajna vijolica | 1 |
| Viola sp. | vijolica | | 9 |
| Viola uliginosa | barska vijolica | | 1 |
| Viola zoysii | zoisova vijolica | | 1 |
| Vipera ammodytes | modras | | 8 |
| Vipera berus | navadni gad | | 4 |
| Vipera berus berus | | | 9 |
| Viscaria vulgaris | navadna smolnica | | 6 |
| Viscum album | bela omela | | 12 |
| Vitis sp. | vinska trta | | 1 |
| Vulpes vulpes | lisica | | 6 |
| Woodsia ilvensis | dlakava vudsovka | | 2 |
| Xanthia sp. | | | 1 |
| Xantho pilipes | | | 1 |
| Xantho poressa | | | 1 |
| Xanthorhoe biriviata | | | 1 |
| Xanthorhoe fluctuata | | | 2 |
| Xanthorhoe montanata | | | 1 |
| Xanthorhoe spadicearia | | | 1 |
| Xenopsylla cheopis | podganja bolha | | 1 |
| Xestia c-nigrum | | | 2 |
| Xestia ditrapezium | | | 1 |
| Xylena vetusta | | | 1 |
| Yponomeuta evonymella | | | 3 |
| Zamenis longissimus | navadni gož | | 10 |
| Zannichellia palustris | močvirska vodopivka | | 3 |
| Zerynthia polyxena | petelinček | | 15 |
| Zeuzera pyrina | jesenov zavrtač | modro sitce | 2 |
| Zingel streber | upiravec | | 7 |
| Zingel zingel | čep | | 4 |
| Zonitidae | pasarji | | 4 |
| Zootoca vivipara | živorodna kuščarica | | 25 |
| Zygaena carniolica | kranjski ovnič | | 7 |
| Zygaena filipendulae | | | 9 |
| Zygaena loti | | | 4 |
| Zygaena purpuralis | | | 2 |
| Zygaena sp. | | | 10 |
| Zygaena transalpina | | | 3 |
| Zygaena viciae | | | 2 |
